RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.66■■■□□ 2.66
LTB-211ENST00000446745 ZFYVE9O95405 1425 aa31.66■■■□□ 2.66
LTB-211ENST00000446745 LRRC7Q96NW7 1537 aa31.65■■■□□ 2.66
LTB-211ENST00000446745 TRIM52Q96A61 297 aa31.63■■■□□ 2.65
LTB-211ENST00000446745 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa31.62■■■□□ 2.65
LTB-211ENST00000446745 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
LTB-211ENST00000446745 SLC26A8Q96RN1 970 aa31.61■■■□□ 2.65
LTB-211ENST00000446745 KCNA6P17658 529 aa31.57■■■□□ 2.64
LTB-211ENST00000446745 PIP4K2BP78356 416 aa31.56■■■□□ 2.64
LTB-211ENST00000446745 TRPM2O94759 1503 aa31.54■■■□□ 2.64
LTB-211ENST00000446745 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
LTB-211ENST00000446745 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 NWD1Q149M9 1564 aa31.49■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 DIP2AQ14689 1571 aa31.48■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 TBX22Q9Y458 520 aa31.48■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 KIF1BO60333 1816 aa31.47■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 CLTCL1P53675 1640 aa31.46■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
LTB-211ENST00000446745 TMEM94Q12767 1356 aa31.44■■■□□ 2.62
LTB-211ENST00000446745 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
LTB-211ENST00000446745 ALKQ9UM73 1620 aa31.42■■■□□ 2.62
LTB-211ENST00000446745 PIK3R4Q99570 1358 aa31.42■■■□□ 2.62
LTB-211ENST00000446745 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa31.4■■■□□ 2.62
LTB-211ENST00000446745 HSPA1LP34931 641 aa31.38■■■□□ 2.61
LTB-211ENST00000446745 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.35■■■□□ 2.61
LTB-211ENST00000446745 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa31.34■■■□□ 2.61
LTB-211ENST00000446745 MSH6P52701 1360 aa31.34■■■□□ 2.61
LTB-211ENST00000446745 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.33■■■□□ 2.61
LTB-211ENST00000446745 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa31.32■■■□□ 2.6
LTB-211ENST00000446745 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.31■■■□□ 2.6
LTB-211ENST00000446745 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa31.3■■■□□ 2.6
LTB-211ENST00000446745 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
LTB-211ENST00000446745 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa31.28■■■□□ 2.6
LTB-211ENST00000446745 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa31.27■■■□□ 2.6
LTB-211ENST00000446745 CCDC144AA2RUR9 1427 aa31.27■■■□□ 2.6
LTB-211ENST00000446745 VGFO15240 615 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
LTB-211ENST00000446745 C14orf37Q86TY3 774 aa31.26■■■□□ 2.59
LTB-211ENST00000446745 FOXD1Q16676 465 aa31.25■■■□□ 2.59
LTB-211ENST00000446745 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa31.25■■■□□ 2.59
LTB-211ENST00000446745 FAM135BQ49AJ0 1406 aa31.24■■■□□ 2.59
LTB-211ENST00000446745 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.18■■■□□ 2.58
LTB-211ENST00000446745 PTPRUQ92729 1446 aa31.18■■■□□ 2.58
LTB-211ENST00000446745 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
LTB-211ENST00000446745 PPLO60437 1756 aa31.17■■■□□ 2.58
LTB-211ENST00000446745 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa31.16■■■□□ 2.58
LTB-211ENST00000446745 C19orf44Q9H6X5 657 aa31.16■■■□□ 2.58
LTB-211ENST00000446745 SLAIN2Q9P270 581 aa31.16■■■□□ 2.58
LTB-211ENST00000446745 CADPS2Q86UW7 1296 aa31.15■■■□□ 2.58
LTB-211ENST00000446745 METP08581 1390 aa31.15■■■□□ 2.58
LTB-211ENST00000446745 ATF3P18847 181 aa31.14■■■□□ 2.58
LTB-211ENST00000446745 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
LTB-211ENST00000446745 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
LTB-211ENST00000446745 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa31.09■■■□□ 2.57
LTB-211ENST00000446745 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa31.08■■■□□ 2.57
LTB-211ENST00000446745 RGL3Q3MIN7 710 aa31.08■■■□□ 2.57
LTB-211ENST00000446745 DCCP43146 1447 aa31.07■■■□□ 2.57
LTB-211ENST00000446745 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
LTB-211ENST00000446745 HRCP23327 699 aa31.05■■■□□ 2.56
LTB-211ENST00000446745 IFT172Q9UG01 1749 aa31.03■■■□□ 2.56
LTB-211ENST00000446745 PTCH1Q13635 1447 aa31.01■■■□□ 2.55
LTB-211ENST00000446745 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
LTB-211ENST00000446745 PHLPP1O60346 1717 aa31■■■□□ 2.55
LTB-211ENST00000446745 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.98■■■□□ 2.55
LTB-211ENST00000446745 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.98■■■□□ 2.55
LTB-211ENST00000446745 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.97■■■□□ 2.55
LTB-211ENST00000446745 ILDR2Q71H61 639 aa30.96■■■□□ 2.55
LTB-211ENST00000446745 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.93■■■□□ 2.54
LTB-211ENST00000446745 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.91■■■□□ 2.54
LTB-211ENST00000446745 PIK3C2GO75747 1445 aa30.9■■■□□ 2.54
LTB-211ENST00000446745 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
LTB-211ENST00000446745 JCADQ9P266 1359 aa30.89■■■□□ 2.54
LTB-211ENST00000446745 MST1RQ04912 1400 aa30.89■■■□□ 2.53
LTB-211ENST00000446745 MYOM2P54296 1465 aa30.88■■■□□ 2.53
LTB-211ENST00000446745 BRINP3Q76B58 766 aa30.87■■■□□ 2.53
LTB-211ENST00000446745 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
LTB-211ENST00000446745 LAMC1P11047 1609 aa30.85■■■□□ 2.53
LTB-211ENST00000446745 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.84■■■□□ 2.53
LTB-211ENST00000446745 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
LTB-211ENST00000446745 STK26Q9P289 416 aa30.82■■■□□ 2.52
LTB-211ENST00000446745 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.82■■■□□ 2.52
LTB-211ENST00000446745 TECPR2O15040 1411 aa30.81■■■□□ 2.52
LTB-211ENST00000446745 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.81■■■□□ 2.52
LTB-211ENST00000446745 SOCS7O14512 581 aa30.8■■■□□ 2.52
LTB-211ENST00000446745 ABCC11Q96J66 1382 aa30.79■■■□□ 2.52
LTB-211ENST00000446745 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
LTB-211ENST00000446745 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.78■■■□□ 2.52
LTB-211ENST00000446745 STAC3Q96MF2 364 aa30.77■■■□□ 2.52
LTB-211ENST00000446745 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
LTB-211ENST00000446745 NHSL1Q5SYE7 1610 aa30.76■■■□□ 2.52
LTB-211ENST00000446745 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.76■■■□□ 2.52
LTB-211ENST00000446745 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.76■■■□□ 2.52
LTB-211ENST00000446745 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
LTB-211ENST00000446745 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.75■■■□□ 2.51
LTB-211ENST00000446745 SHPRHQ149N8 1683 aa30.74■■■□□ 2.51
LTB-211ENST00000446745 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms