RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
NELFE-204ENST00000436289 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.66■■□□□ 1.38
NELFE-204ENST00000436289 NOS1P29475 1434 aa23.66■■□□□ 1.38
NELFE-204ENST00000436289 TRIM52Q96A61 297 aa23.65■■□□□ 1.38
NELFE-204ENST00000436289 TBX22Q9Y458 520 aa23.65■■□□□ 1.38
NELFE-204ENST00000436289 ABCC5O15440 1437 aa23.64■■□□□ 1.37
NELFE-204ENST00000436289 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.64■■□□□ 1.37
NELFE-204ENST00000436289 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.63■■□□□ 1.37
NELFE-204ENST00000436289 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.62■■□□□ 1.37
NELFE-204ENST00000436289 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
NELFE-204ENST00000436289 C14orf37Q86TY3 774 aa23.62■■□□□ 1.37
NELFE-204ENST00000436289 ADGRB3O60242 1522 aa23.62■■□□□ 1.37
NELFE-204ENST00000436289 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
NELFE-204ENST00000436289 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
NELFE-204ENST00000436289 ATF3P18847 181 aa23.61■■□□□ 1.37
NELFE-204ENST00000436289 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.61■■□□□ 1.37
NELFE-204ENST00000436289 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
NELFE-204ENST00000436289 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
NELFE-204ENST00000436289 LRP6O75581 1613 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-204ENST00000436289 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
NELFE-204ENST00000436289 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
NELFE-204ENST00000436289 ZFYVE9O95405 1425 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-204ENST00000436289 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
NELFE-204ENST00000436289 PIK3R4Q99570 1358 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-204ENST00000436289 DAPK1P53355 1430 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-204ENST00000436289 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.53■■□□□ 1.36
NELFE-204ENST00000436289 SHPRHQ149N8 1683 aa23.53■■□□□ 1.36
NELFE-204ENST00000436289 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.52■■□□□ 1.36
NELFE-204ENST00000436289 FOXD1Q16676 465 aa23.51■■□□□ 1.35
NELFE-204ENST00000436289 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.48■■□□□ 1.35
NELFE-204ENST00000436289 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
NELFE-204ENST00000436289 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
NELFE-204ENST00000436289 BRINP3Q76B58 766 aa23.48■■□□□ 1.35
NELFE-204ENST00000436289 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
NELFE-204ENST00000436289 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.48■■□□□ 1.35
NELFE-204ENST00000436289 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NELFE-204ENST00000436289 APLP2Q06481 763 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-204ENST00000436289 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NELFE-204ENST00000436289 AFF2P51816 1311 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-204ENST00000436289 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
NELFE-204ENST00000436289 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
NELFE-204ENST00000436289 DIP2AQ14689 1571 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-204ENST00000436289 DCCP43146 1447 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-204ENST00000436289 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-204ENST00000436289 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-204ENST00000436289 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-204ENST00000436289 NGLY1Q96IV0 654 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-204ENST00000436289 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-204ENST00000436289 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
NELFE-204ENST00000436289 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-204ENST00000436289 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.38■■□□□ 1.33
NELFE-204ENST00000436289 ADGRL2O95490 1459 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-204ENST00000436289 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
NELFE-204ENST00000436289 C8orf37Q96NL8 207 aa23.37■■□□□ 1.33
NELFE-204ENST00000436289 TRPM2O94759 1503 aa23.35■■□□□ 1.33
NELFE-204ENST00000436289 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.35■■□□□ 1.33
NELFE-204ENST00000436289 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.34■■□□□ 1.33
NELFE-204ENST00000436289 RGS12O14924 1447 aa23.33■■□□□ 1.33
NELFE-204ENST00000436289 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.33■■□□□ 1.33
NELFE-204ENST00000436289 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.33■■□□□ 1.33
NELFE-204ENST00000436289 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.33■■□□□ 1.33
NELFE-204ENST00000436289 CCDC125Q86Z20 511 aa23.3■■□□□ 1.32
NELFE-204ENST00000436289 MST1RQ04912 1400 aa23.3■■□□□ 1.32
NELFE-204ENST00000436289 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-204ENST00000436289 PTPRUQ92729 1446 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-204ENST00000436289 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
NELFE-204ENST00000436289 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-204ENST00000436289 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.25■■□□□ 1.31
NELFE-204ENST00000436289 USP21Q9UK80 565 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-204ENST00000436289 ADAMTS2O95450 1211 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-204ENST00000436289 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
NELFE-204ENST00000436289 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
NELFE-204ENST00000436289 UNC13BO14795 1591 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-204ENST00000436289 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-204ENST00000436289 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
NELFE-204ENST00000436289 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
NELFE-204ENST00000436289 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-204ENST00000436289 PTCH1Q13635 1447 aa23.17■■□□□ 1.3
NELFE-204ENST00000436289 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
NELFE-204ENST00000436289 E9PCH4 1651 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-204ENST00000436289 METP08581 1390 aa23.14■■□□□ 1.3
NELFE-204ENST00000436289 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
NELFE-204ENST00000436289 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-204ENST00000436289 NUP155O75694 1391 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-204ENST00000436289 ROCK1Q13464 1354 aa23.12■■□□□ 1.29
NELFE-204ENST00000436289 ATRNO75882 1429 aa23.11■■□□□ 1.29
NELFE-204ENST00000436289 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.1■■□□□ 1.29
NELFE-204ENST00000436289 LAMC1P11047 1609 aa23.09■■□□□ 1.29
NELFE-204ENST00000436289 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.09■■□□□ 1.29
NELFE-204ENST00000436289 ORAI2Q96SN7 254 aa23.06■■□□□ 1.28
NELFE-204ENST00000436289 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
NELFE-204ENST00000436289 EP400Q96L91 3159 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-204ENST00000436289 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-204ENST00000436289 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
NELFE-204ENST00000436289 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-204ENST00000436289 BCL9LQ86UU0 1499 aa23■■□□□ 1.27
NELFE-204ENST00000436289 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NELFE-204ENST00000436289 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
NELFE-204ENST00000436289 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
NELFE-204ENST00000436289 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
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