RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 UGGT1Q9NYU2 1555 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 KANK1Q14678 1352 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMTS8Q9UP79 889 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 RCAN3Q9UKA8 241 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE4AP27815 886 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 EFCAB6Q5THR3 1501 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 TET3O43151 1660 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCA6Q8N139 1617 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRB3O60242 1522 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 CHD1O14646 1710 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP2R1AP30153 589 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 DEKP35659 375 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 PANK3Q9H999 370 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 CEP152O94986 1710 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPY4P0CV99 314 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPY10P0CW01 314 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRB2O60241 1585 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 FANCAO15360 1455 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 SLFN5Q08AF3 891 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCC3O15438 1527 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 PIK3C2BO00750 1634 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC136Q96JN2 1154 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 USP32Q8NFA0 1604 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 PLIN1O60240 522 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 STAC3Q96MF2 364 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP5Q13017 1502 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 TMC1Q8TDI8 760 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 MYT1LQ9UL68 1186 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP7AQ04656 1500 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 MROH2AA6NES4 1674 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ANTXR1Q9H6X2 564 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 NOS1P29475 1434 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 NPATQ14207 1427 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ZMYM3Q14202 1370 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 AFAP1Q8N556 730 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 CD163L1Q9NR16 1453 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 CRBNQ96SW2 442 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 TULP4Q9NRJ4 1543 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 CD109Q6YHK3 1445 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRL1O94910 1474 aa4.84□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 USP35Q9P2H5 1018 aa4.84□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 MLH3Q9UHC1 1453 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 SEC24BO95487 1268 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHDP01880 384 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 RLBP1P12271 317 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 DDIT3P35638 169 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 IL27Q8NEV9 243 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 HECW2Q9P2P5 1572 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 PNPLA6Q8IY17 1366 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFYVE9O95405 1425 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 RGL3Q3MIN7 710 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 PPLO60437 1756 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP70Q5T0N1 1121 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 YEATS2Q9ULM3 1422 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 MED14O60244 1454 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 BCAR3O75815 825 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 TMF1P82094 1093 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 TNNQ9UQP3 1299 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC27Q2M243 656 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 POGZQ7Z3K3 1410 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 NGEFQ8N5V2 710 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 WWC1Q8IX03 1113 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE3AQ14432 1141 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRMP28827 1452 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCC11Q96J66 1382 aa4.8□□□□□ -1.64
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