RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376959.6

KCNC3-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene KCNC3, Length 5,447 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3-201ENST00000376959 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
KCNC3-201ENST00000376959 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
KCNC3-201ENST00000376959 AMPHP49418 695 aa27.15■■□□□ 1.94
KCNC3-201ENST00000376959 PANK3Q9H999 370 aa27.15■■□□□ 1.94
KCNC3-201ENST00000376959 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
KCNC3-201ENST00000376959 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.15■■□□□ 1.94
KCNC3-201ENST00000376959 CCDC66A2RUB6 948 aa27.13■■□□□ 1.93
KCNC3-201ENST00000376959 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
KCNC3-201ENST00000376959 NGEFQ8N5V2 710 aa27.13■■□□□ 1.93
KCNC3-201ENST00000376959 NASPP49321 788 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
KCNC3-201ENST00000376959 CPLX1O14810 134 aa27.12■■□□□ 1.93
KCNC3-201ENST00000376959 RNF20Q5VTR2 975 aa27.12■■□□□ 1.93
KCNC3-201ENST00000376959 SMC3Q9UQE7 1217 aa27.12■■□□□ 1.93
KCNC3-201ENST00000376959 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
KCNC3-201ENST00000376959 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa27.1■■□□□ 1.93
KCNC3-201ENST00000376959 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.1■■□□□ 1.93
KCNC3-201ENST00000376959 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
KCNC3-201ENST00000376959 G3V3G9 751 aa27.09■■□□□ 1.93
KCNC3-201ENST00000376959 DCAF8Q5TAQ9 597 aa27.09■■□□□ 1.93
KCNC3-201ENST00000376959 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
KCNC3-201ENST00000376959 C22orf23Q9BZE7 217 aa27.08■■□□□ 1.93
KCNC3-201ENST00000376959 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
KCNC3-201ENST00000376959 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.07■■□□□ 1.92
KCNC3-201ENST00000376959 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.07■■□□□ 1.92
KCNC3-201ENST00000376959 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
KCNC3-201ENST00000376959 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
KCNC3-201ENST00000376959 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
KCNC3-201ENST00000376959 ROCK1Q13464 1354 aa27.04■■□□□ 1.92
KCNC3-201ENST00000376959 AAMPQ13685 434 aa27.04■■□□□ 1.92
KCNC3-201ENST00000376959 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
KCNC3-201ENST00000376959 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
KCNC3-201ENST00000376959 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
KCNC3-201ENST00000376959 H0YHG0 523 aa27.03■■□□□ 1.92
KCNC3-201ENST00000376959 APAF1O14727 1248 aa27.03■■□□□ 1.92
KCNC3-201ENST00000376959 DCTN1Q14203 1278 aa27.03■■□□□ 1.92
KCNC3-201ENST00000376959 CCDC191Q8NCU4 936 aa27.03■■□□□ 1.92
KCNC3-201ENST00000376959 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
KCNC3-201ENST00000376959 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
KCNC3-201ENST00000376959 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.01■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 PKNOX2Q96KN3 472 aa27■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 NEXNQ0ZGT2 675 aa27■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 TRDNQ13061 729 aa27■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 RDXP35241 583 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 WWC1Q8IX03 1113 aa26.99■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 TRAK2O60296 914 aa26.98■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 KIF3BO15066 747 aa26.98■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.97■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 FBXW7Q969H0 707 aa26.97■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 AMOTL1Q8IY63 956 aa26.96■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.96■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 MBD3O95983 291 aa26.96■■□□□ 1.91
KCNC3-201ENST00000376959 OLFM4Q6UX06 510 aa26.95■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 CCDC173Q0VFZ6 552 aa26.94■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 RNF214Q8ND24 703 aa26.94■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 APPP05067 770 aa26.94■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 USP47Q96K76 1375 aa26.93■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 CDC45O75419 566 aa26.93■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 COG3Q96JB2 828 aa26.93■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa26.92■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 CCP110O43303 1012 aa26.92■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.92■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa26.91■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 LNPKQ9C0E8 428 aa26.91■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 TEFQ10587 303 aa26.91■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 NFXL1Q6ZNB6 911 aa26.91■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.91■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 CAGE1Q8TC20 777 aa26.91■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 ERC2O15083 957 aa26.9■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 TRIM5Q9C035 493 aa26.9■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.9■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 LEKR1Q6ZMV7 388 aa26.9■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 PDILTQ8N807 584 aa26.9■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
KCNC3-201ENST00000376959 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.9
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KCNC3-201ENST00000376959 TSPY26PQ9H489 355 aa26.89■■□□□ 1.89
KCNC3-201ENST00000376959 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
KCNC3-201ENST00000376959 ERICH2A1L162 156 aa26.88■■□□□ 1.89
KCNC3-201ENST00000376959 EVC2Q86UK5 1308 aa26.87■■□□□ 1.89
KCNC3-201ENST00000376959 EID1Q9Y6B2 187 aa26.87■■□□□ 1.89
KCNC3-201ENST00000376959 UACAQ9BZF9 1416 aa26.87■■□□□ 1.89
KCNC3-201ENST00000376959 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
KCNC3-201ENST00000376959 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
KCNC3-201ENST00000376959 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.86■■□□□ 1.89
KCNC3-201ENST00000376959 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
KCNC3-201ENST00000376959 RIPK4P57078 832 aa26.86■■□□□ 1.89
KCNC3-201ENST00000376959 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
KCNC3-201ENST00000376959 MYO6Q9UM54 1294 aa26.85■■□□□ 1.89
KCNC3-201ENST00000376959 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
KCNC3-201ENST00000376959 RUNDC1Q96C34 613 aa26.84■■□□□ 1.89
KCNC3-201ENST00000376959 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
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