RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
PPP1CC-201ENST00000335007 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.14■■□□□ 1.78
PPP1CC-201ENST00000335007 PIK3C2GO75747 1445 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP1CC-201ENST00000335007 USP19O94966 1318 aa26.13■■□□□ 1.77
PPP1CC-201ENST00000335007 SYNMO15061 1565 aa26.12■■□□□ 1.77
PPP1CC-201ENST00000335007 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PPP1CC-201ENST00000335007 ABCC2Q92887 1545 aa26.11■■□□□ 1.77
PPP1CC-201ENST00000335007 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.11■■□□□ 1.77
PPP1CC-201ENST00000335007 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.11■■□□□ 1.77
PPP1CC-201ENST00000335007 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.1■■□□□ 1.77
PPP1CC-201ENST00000335007 ATP10BO94823 1461 aa26.09■■□□□ 1.77
PPP1CC-201ENST00000335007 POGKQ9P215 609 aa26.09■■□□□ 1.77
PPP1CC-201ENST00000335007 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.08■■□□□ 1.77
PPP1CC-201ENST00000335007 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PPP1CC-201ENST00000335007 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.07■■□□□ 1.76
PPP1CC-201ENST00000335007 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.07■■□□□ 1.76
PPP1CC-201ENST00000335007 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.07■■□□□ 1.76
PPP1CC-201ENST00000335007 IQGAP1P46940 1657 aa26.07■■□□□ 1.76
PPP1CC-201ENST00000335007 PREX2Q70Z35 1606 aa26.06■■□□□ 1.76
PPP1CC-201ENST00000335007 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.06■■□□□ 1.76
PPP1CC-201ENST00000335007 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.05■■□□□ 1.76
PPP1CC-201ENST00000335007 IGHDP01880 384 aa26.04■■□□□ 1.76
PPP1CC-201ENST00000335007 ATP10AO60312 1499 aa26.04■■□□□ 1.76
PPP1CC-201ENST00000335007 NLRP1Q9C000 1473 aa26.04■■□□□ 1.76
PPP1CC-201ENST00000335007 PLXNC1O60486 1568 aa26.04■■□□□ 1.76
PPP1CC-201ENST00000335007 ERCC6Q03468 1493 aa26.04■■□□□ 1.76
PPP1CC-201ENST00000335007 E9PSI1 815 aa26.03■■□□□ 1.76
PPP1CC-201ENST00000335007 BCAR3O75815 825 aa26.02■■□□□ 1.76
PPP1CC-201ENST00000335007 PDE3AQ14432 1141 aa26.02■■□□□ 1.76
PPP1CC-201ENST00000335007 CDCA8Q53HL2 280 aa26.02■■□□□ 1.76
PPP1CC-201ENST00000335007 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.02■■□□□ 1.76
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.99■■□□□ 1.75
PPP1CC-201ENST00000335007 NGEFQ8N5V2 710 aa25.99■■□□□ 1.75
PPP1CC-201ENST00000335007 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PPP1CC-201ENST00000335007 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PPP1CC-201ENST00000335007 SEC24BO95487 1268 aa25.99■■□□□ 1.75
PPP1CC-201ENST00000335007 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.99■■□□□ 1.75
PPP1CC-201ENST00000335007 MYOM1P52179 1685 aa25.98■■□□□ 1.75
PPP1CC-201ENST00000335007 MADDQ8WXG6 1647 aa25.98■■□□□ 1.75
PPP1CC-201ENST00000335007 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PPP1CC-201ENST00000335007 ZMYM3Q14202 1370 aa25.97■■□□□ 1.75
PPP1CC-201ENST00000335007 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.97■■□□□ 1.75
PPP1CC-201ENST00000335007 APAF1O14727 1248 aa25.97■■□□□ 1.75
PPP1CC-201ENST00000335007 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PPP1CC-201ENST00000335007 JPH4Q96JJ6 628 aa25.96■■□□□ 1.75
PPP1CC-201ENST00000335007 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.751e-6■■□□□ 12.7
PPP1CC-201ENST00000335007 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PPP1CC-201ENST00000335007 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.95■■□□□ 1.74
PPP1CC-201ENST00000335007 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PPP1CC-201ENST00000335007 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PPP1CC-201ENST00000335007 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PPP1CC-201ENST00000335007 AAMPQ13685 434 aa25.91■■□□□ 1.74
PPP1CC-201ENST00000335007 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PPP1CC-201ENST00000335007 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.9■■□□□ 1.74
PPP1CC-201ENST00000335007 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.9■■□□□ 1.74
PPP1CC-201ENST00000335007 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.89■■□□□ 1.73
PPP1CC-201ENST00000335007 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.88■■□□□ 1.73
PPP1CC-201ENST00000335007 COG6Q9Y2V7 657 aa25.88■■□□□ 1.73
PPP1CC-201ENST00000335007 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.88■■□□□ 1.73
PPP1CC-201ENST00000335007 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.87■■□□□ 1.73
PPP1CC-201ENST00000335007 PANK1Q8TE04 598 aa25.86■■□□□ 1.73
PPP1CC-201ENST00000335007 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.86■■□□□ 1.73
PPP1CC-201ENST00000335007 FSD2A1L4K1 749 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-201ENST00000335007 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP1CC-201ENST00000335007 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP1CC-201ENST00000335007 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.83■■□□□ 1.72
PPP1CC-201ENST00000335007 CEP152O94986 1710 aa25.82■■□□□ 1.72
PPP1CC-201ENST00000335007 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
PPP1CC-201ENST00000335007 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-201ENST00000335007 STAC3Q96MF2 364 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-201ENST00000335007 MCM4P33991 863 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP1CC-201ENST00000335007 FBLN2P98095 1184 aa25.79■■□□□ 1.72
PPP1CC-201ENST00000335007 CLCN1P35523 988 aa25.79■■□□□ 1.72
PPP1CC-201ENST00000335007 WWC1Q8IX03 1113 aa25.78■■□□□ 1.72
PPP1CC-201ENST00000335007 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PPP1CC-201ENST00000335007 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.77■■□□□ 1.72
PPP1CC-201ENST00000335007 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.76■■□□□ 1.71
PPP1CC-201ENST00000335007 TRPM2O94759 1503 aa25.75■■□□□ 1.71
PPP1CC-201ENST00000335007 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PPP1CC-201ENST00000335007 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PPP1CC-201ENST00000335007 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PPP1CC-201ENST00000335007 ARXQ96QS3 562 aa25.74■■□□□ 1.71
PPP1CC-201ENST00000335007 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PPP1CC-201ENST00000335007 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.74■■□□□ 1.71
PPP1CC-201ENST00000335007 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.74■■□□□ 1.71
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC24A1O60721 1099 aa25.73■■□□□ 1.71
PPP1CC-201ENST00000335007 MRE11P49959 708 aa25.71■■□□□ 1.71
PPP1CC-201ENST00000335007 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.712e-6■□□□□ 10.8
PPP1CC-201ENST00000335007 PANK2Q9BZ23 570 aa25.7■■□□□ 1.71
PPP1CC-201ENST00000335007 SHPRHQ149N8 1683 aa25.7■■□□□ 1.7
PPP1CC-201ENST00000335007 TRAK2O60296 914 aa25.69■■□□□ 1.7
PPP1CC-201ENST00000335007 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
PPP1CC-201ENST00000335007 ERVK-7P63135 1459 aa25.68■■□□□ 1.7
PPP1CC-201ENST00000335007 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
PPP1CC-201ENST00000335007 CLTCL1P53675 1640 aa25.67■■□□□ 1.7
PPP1CC-201ENST00000335007 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.67■■□□□ 1.7
PPP1CC-201ENST00000335007 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.67■■□□□ 1.7
PPP1CC-201ENST00000335007 RLBP1P12271 317 aa25.67■■□□□ 1.7
PPP1CC-201ENST00000335007 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.66■■□□□ 1.7
PPP1CC-201ENST00000335007 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms