RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327347.9

SEPHS1-201, Transcript of selenophosphate synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPHS1, Length 3,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPHS1-201ENST00000327347 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.41■■□□□ 1.18
SEPHS1-201ENST00000327347 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SEPHS1-201ENST00000327347 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.41■■□□□ 1.18
SEPHS1-201ENST00000327347 NFKBIBQ15653 356 aa22.41■■□□□ 1.18
SEPHS1-201ENST00000327347 UNC13BO14795 1591 aa22.39■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 SLFN5Q08AF3 891 aa22.38■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.38■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.37■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 C8orf34Q49A92 452 aa22.37■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.37■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 FAM161AQ3B820 660 aa22.36■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.35■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF521Q96K83 1311 aa22.35■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.35■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.34■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 CDCA8Q53HL2 280 aa22.33■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 USP35Q9P2H5 1018 aa22.33■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.33■■□□□ 1.17
SEPHS1-201ENST00000327347 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SEPHS1-201ENST00000327347 GSE1Q14687 1217 aa22.31■■□□□ 1.16
SEPHS1-201ENST00000327347 PANK1Q8TE04 598 aa22.31■■□□□ 1.16
SEPHS1-201ENST00000327347 KIF3BO15066 747 aa22.31■■□□□ 1.16
SEPHS1-201ENST00000327347 IGHDP01880 384 aa22.31■■□□□ 1.16
SEPHS1-201ENST00000327347 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SEPHS1-201ENST00000327347 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.3■■□□□ 1.16
SEPHS1-201ENST00000327347 COG6Q9Y2V7 657 aa22.3■■□□□ 1.16
SEPHS1-201ENST00000327347 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.3■■□□□ 1.16
SEPHS1-201ENST00000327347 LAMC1P11047 1609 aa22.28■■□□□ 1.16
SEPHS1-201ENST00000327347 INSRP06213 1382 aa22.28■■□□□ 1.16
SEPHS1-201ENST00000327347 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.27■■□□□ 1.16
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SEPHS1-201ENST00000327347 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.27■■□□□ 1.16
SEPHS1-201ENST00000327347 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.27■■□□□ 1.16
SEPHS1-201ENST00000327347 ATP10AO60312 1499 aa22.25■■□□□ 1.15
SEPHS1-201ENST00000327347 PLXNC1O60486 1568 aa22.25■■□□□ 1.15
SEPHS1-201ENST00000327347 PLCH2O75038 1416 aa22.24■■□□□ 1.15
SEPHS1-201ENST00000327347 MADDQ8WXG6 1647 aa22.24■■□□□ 1.15
SEPHS1-201ENST00000327347 E9PSI1 815 aa22.23■■□□□ 1.15
SEPHS1-201ENST00000327347 TNNQ9UQP3 1299 aa22.23■■□□□ 1.15
SEPHS1-201ENST00000327347 SEC24BO95487 1268 aa22.22■■□□□ 1.15
SEPHS1-201ENST00000327347 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SEPHS1-201ENST00000327347 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.21■■□□□ 1.15
SEPHS1-201ENST00000327347 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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SEPHS1-201ENST00000327347 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.21■■□□□ 1.15
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SEPHS1-201ENST00000327347 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.2■■□□□ 1.14
SEPHS1-201ENST00000327347 PIK3C2GO75747 1445 aa22.2■■□□□ 1.14
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SEPHS1-201ENST00000327347 CHD1O14646 1710 aa22.19■■□□□ 1.14
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SEPHS1-201ENST00000327347 WWC1Q8IX03 1113 aa22.18■■□□□ 1.14
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.18■■□□□ 1.14
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SEPHS1-201ENST00000327347 CLTCL1P53675 1640 aa22.17■■□□□ 1.14
SEPHS1-201ENST00000327347 IQGAP1P46940 1657 aa22.17■■□□□ 1.14
SEPHS1-201ENST00000327347 SYNMO15061 1565 aa22.17■■□□□ 1.14
SEPHS1-201ENST00000327347 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.16■■□□□ 1.14
SEPHS1-201ENST00000327347 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SEPHS1-201ENST00000327347 POGKQ9P215 609 aa22.14■■□□□ 1.14
SEPHS1-201ENST00000327347 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.14■■□□□ 1.13
SEPHS1-201ENST00000327347 KANK1Q14678 1352 aa22.14■■□□□ 1.13
SEPHS1-201ENST00000327347 ABCC1P33527 1531 aa22.13■■□□□ 1.13
SEPHS1-201ENST00000327347 TRPM2O94759 1503 aa22.12■■□□□ 1.13
SEPHS1-201ENST00000327347 RLBP1P12271 317 aa22.12■■□□□ 1.13
SEPHS1-201ENST00000327347 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.12■■□□□ 1.13
SEPHS1-201ENST00000327347 ERVK-7P63135 1459 aa22.12■■□□□ 1.13
SEPHS1-201ENST00000327347 MYOM1P52179 1685 aa22.11■■□□□ 1.13
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SEPHS1-201ENST00000327347 USP19O94966 1318 aa22.09■■□□□ 1.13
SEPHS1-201ENST00000327347 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.09■■□□□ 1.13
SEPHS1-201ENST00000327347 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.08■■□□□ 1.13
SEPHS1-201ENST00000327347 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.08■■□□□ 1.13
SEPHS1-201ENST00000327347 PTPRTO14522 1441 aa22.08■■□□□ 1.13
SEPHS1-201ENST00000327347 MTHFSP49914 203 aa22.07■■□□□ 1.12
SEPHS1-201ENST00000327347 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SEPHS1-201ENST00000327347 PDE3AQ14432 1141 aa22.07■■□□□ 1.12
SEPHS1-201ENST00000327347 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.06■■□□□ 1.12
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SEPHS1-201ENST00000327347 GGT6Q6P531 493 aa22.05■■□□□ 1.12
SEPHS1-201ENST00000327347 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.04■■□□□ 1.12
SEPHS1-201ENST00000327347 RUNDC1Q96C34 613 aa22.04■■□□□ 1.12
SEPHS1-201ENST00000327347 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.03■■□□□ 1.12
SEPHS1-201ENST00000327347 CEP152O94986 1710 aa22.03■■□□□ 1.12
SEPHS1-201ENST00000327347 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SEPHS1-201ENST00000327347 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
SEPHS1-201ENST00000327347 STAC3Q96MF2 364 aa22.03■■□□□ 1.12
SEPHS1-201ENST00000327347 NOS1P29475 1434 aa22.02■■□□□ 1.12
SEPHS1-201ENST00000327347 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.02■■□□□ 1.12
SEPHS1-201ENST00000327347 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
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