RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268661.7

RPL3L-201, Transcript of ribosomal protein L3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPL3L, Length 2,182 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3L-201ENST00000268661 PPP2R1AP30153 589 aa21.43■■□□□ 1.02
RPL3L-201ENST00000268661 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
RPL3L-201ENST00000268661 GOLGA2Q08379 1002 aa21.41■■□□□ 1.02
RPL3L-201ENST00000268661 SLC4A3P48751 1232 aa21.41■■□□□ 1.02
RPL3L-201ENST00000268661 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RPL3L-201ENST00000268661 PIK3C2GO75747 1445 aa21.4■■□□□ 1.02
RPL3L-201ENST00000268661 MADDQ8WXG6 1647 aa21.4■■□□□ 1.02
RPL3L-201ENST00000268661 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
RPL3L-201ENST00000268661 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
RPL3L-201ENST00000268661 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
RPL3L-201ENST00000268661 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
RPL3L-201ENST00000268661 SLFN5Q08AF3 891 aa21.38■■□□□ 1.01
RPL3L-201ENST00000268661 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.38■■□□□ 1.01
RPL3L-201ENST00000268661 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.37■■□□□ 1.01
RPL3L-201ENST00000268661 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.37■■□□□ 1.01
RPL3L-201ENST00000268661 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
RPL3L-201ENST00000268661 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.37■■□□□ 1.01
RPL3L-201ENST00000268661 ABCC2Q92887 1545 aa21.37■■□□□ 1.01
RPL3L-201ENST00000268661 MYOM1P52179 1685 aa21.36■■□□□ 1.01
RPL3L-201ENST00000268661 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.36■■□□□ 1.01
RPL3L-201ENST00000268661 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.35■■□□□ 1.01
RPL3L-201ENST00000268661 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
RPL3L-201ENST00000268661 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.35■■□□□ 1.01
RPL3L-201ENST00000268661 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.33■■□□□ 1.01
RPL3L-201ENST00000268661 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
RPL3L-201ENST00000268661 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 1
RPL3L-201ENST00000268661 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.31■■□□□ 1
RPL3L-201ENST00000268661 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.31■■□□□ 1
RPL3L-201ENST00000268661 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.31■■□□□ 1
RPL3L-201ENST00000268661 CDCA8Q53HL2 280 aa21.3■■□□□ 1
RPL3L-201ENST00000268661 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.29■■□□□ 1
RPL3L-201ENST00000268661 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
RPL3L-201ENST00000268661 CEP152O94986 1710 aa21.29■■□□□ 1
RPL3L-201ENST00000268661 RGS3P49796 1198 aa21.29■■□□□ 1
RPL3L-201ENST00000268661 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
RPL3L-201ENST00000268661 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
RPL3L-201ENST00000268661 TRPM2O94759 1503 aa21.25■□□□□ 0.99
RPL3L-201ENST00000268661 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
RPL3L-201ENST00000268661 USP19O94966 1318 aa21.25■□□□□ 0.99
RPL3L-201ENST00000268661 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.24■□□□□ 0.99
RPL3L-201ENST00000268661 E9PSI1 815 aa21.23■□□□□ 0.99
RPL3L-201ENST00000268661 NGEFQ8N5V2 710 aa21.23■□□□□ 0.99
RPL3L-201ENST00000268661 STAC3Q96MF2 364 aa21.23■□□□□ 0.99
RPL3L-201ENST00000268661 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.23■□□□□ 0.99
RPL3L-201ENST00000268661 BCAR3O75815 825 aa21.21■□□□□ 0.99
RPL3L-201ENST00000268661 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.21■□□□□ 0.99
RPL3L-201ENST00000268661 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.21■□□□□ 0.99
RPL3L-201ENST00000268661 APAF1O14727 1248 aa21.21■□□□□ 0.99
RPL3L-201ENST00000268661 IGHDP01880 384 aa21.2■□□□□ 0.98
RPL3L-201ENST00000268661 PDE3AQ14432 1141 aa21.2■□□□□ 0.98
RPL3L-201ENST00000268661 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
RPL3L-201ENST00000268661 CLTCL1P53675 1640 aa21.19■□□□□ 0.98
RPL3L-201ENST00000268661 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.19■□□□□ 0.98
RPL3L-201ENST00000268661 PTPRTO14522 1441 aa21.18■□□□□ 0.98
RPL3L-201ENST00000268661 NLRP1Q9C000 1473 aa21.18■□□□□ 0.98
RPL3L-201ENST00000268661 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.15■□□□□ 0.98
RPL3L-201ENST00000268661 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.14■□□□□ 0.98
RPL3L-201ENST00000268661 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.14■□□□□ 0.98
RPL3L-201ENST00000268661 ABCC1P33527 1531 aa21.14■□□□□ 0.98
RPL3L-201ENST00000268661 DEPDC5O75140 1603 aa21.14■□□□□ 0.97
RPL3L-201ENST00000268661 SHROOM2Q13796 1616 aa21.14■□□□□ 0.97
RPL3L-201ENST00000268661 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.14■□□□□ 0.97
RPL3L-201ENST00000268661 ZMYM3Q14202 1370 aa21.13■□□□□ 0.97
RPL3L-201ENST00000268661 PLCH2O75038 1416 aa21.12■□□□□ 0.97
RPL3L-201ENST00000268661 ERVK-7P63135 1459 aa21.12■□□□□ 0.97
RPL3L-201ENST00000268661 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
RPL3L-201ENST00000268661 SEC24BO95487 1268 aa21.12■□□□□ 0.97
RPL3L-201ENST00000268661 BECN1Q14457 450 aa21.12■□□□□ 0.97
RPL3L-201ENST00000268661 TET3O43151 1660 aa21.12■□□□□ 0.97
RPL3L-201ENST00000268661 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
RPL3L-201ENST00000268661 SLC24A1O60721 1099 aa21.1■□□□□ 0.97
RPL3L-201ENST00000268661 SHPRHQ149N8 1683 aa21.1■□□□□ 0.97
RPL3L-201ENST00000268661 AAMPQ13685 434 aa21.09■□□□□ 0.97
RPL3L-201ENST00000268661 WWC1Q8IX03 1113 aa21.08■□□□□ 0.97
RPL3L-201ENST00000268661 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.07■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.07■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.07■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 PANK1Q8TE04 598 aa21.07■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.07■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 COG6Q9Y2V7 657 aa21.07■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 ABCA6Q8N139 1617 aa21.07■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.06■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 POGKQ9P215 609 aa21.06■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 MYOM2P54296 1465 aa21.06■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.06■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.05■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.05■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.04■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.04■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.04■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.03■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 IFT172Q9UG01 1749 aa21.03■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.03■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.02■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.02■□□□□ 0.96
RPL3L-201ENST00000268661 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.01■□□□□ 0.95
RPL3L-201ENST00000268661 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
RPL3L-201ENST00000268661 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
RPL3L-201ENST00000268661 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.3 ms