RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264828.3

COL5A3-201, Transcript of collagen type V alpha 3 chain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COL5A3, Length 6,174 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3-201ENST00000264828 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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COL5A3-201ENST00000264828 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.05■■□□□ 1.12
COL5A3-201ENST00000264828 FBXW7Q969H0 707 aa22.05■■□□□ 1.12
COL5A3-201ENST00000264828 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.05■■□□□ 1.12
COL5A3-201ENST00000264828 UACAQ9BZF9 1416 aa22.05■■□□□ 1.12
COL5A3-201ENST00000264828 TPM1P09493 284 aa22.05■■□□□ 1.12
COL5A3-201ENST00000264828 TPM2P07951 284 aa22.04■■□□□ 1.12
COL5A3-201ENST00000264828 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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COL5A3-201ENST00000264828 E9PSI1 815 aa22.04■■□□□ 1.12
COL5A3-201ENST00000264828 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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COL5A3-201ENST00000264828 NECTIN2Q92692 538 aa22.02■■□□□ 1.12
COL5A3-201ENST00000264828 FBXO3Q9UK99 471 aa22.01■■□□□ 1.11
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.01■■□□□ 1.11
COL5A3-201ENST00000264828 FOSBP53539 338 aa22■■□□□ 1.11
COL5A3-201ENST00000264828 RAD21O60216 631 aa22■■□□□ 1.11
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COL5A3-201ENST00000264828 HOMER1Q86YM7 354 aa21.98■■□□□ 1.11
COL5A3-201ENST00000264828 BICD2Q8TD16 824 aa21.98■■□□□ 1.11
COL5A3-201ENST00000264828 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
COL5A3-201ENST00000264828 APAF1O14727 1248 aa21.97■■□□□ 1.11
COL5A3-201ENST00000264828 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.97■■□□□ 1.11
COL5A3-201ENST00000264828 TRIM29Q14134 588 aa21.96■■□□□ 1.11
COL5A3-201ENST00000264828 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.96■■□□□ 1.11
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COL5A3-201ENST00000264828 CUX1P39880 1505 aa21.95■■□□□ 1.1
COL5A3-201ENST00000264828 REC8O95072 547 aa21.94■■□□□ 1.1
COL5A3-201ENST00000264828 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.94■■□□□ 1.1
COL5A3-201ENST00000264828 COG3Q96JB2 828 aa21.94■■□□□ 1.1
COL5A3-201ENST00000264828 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
COL5A3-201ENST00000264828 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.94■■□□□ 1.1
COL5A3-201ENST00000264828 APPP05067 770 aa21.93■■□□□ 1.1
COL5A3-201ENST00000264828 OSCARQ8IYS5 282 aa21.93■■□□□ 1.1
COL5A3-201ENST00000264828 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
COL5A3-201ENST00000264828 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
COL5A3-201ENST00000264828 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.93■■□□□ 1.1
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COL5A3-201ENST00000264828 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.91■■□□□ 1.1
COL5A3-201ENST00000264828 TEX35Q5T0J7 233 aa21.91■■□□□ 1.1
COL5A3-201ENST00000264828 CPLX1O14810 134 aa21.91■■□□□ 1.1
COL5A3-201ENST00000264828 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.91■■□□□ 1.1
COL5A3-201ENST00000264828 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
COL5A3-201ENST00000264828 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
COL5A3-201ENST00000264828 USP47Q96K76 1375 aa21.89■■□□□ 1.1
COL5A3-201ENST00000264828 IFT57Q9NWB7 429 aa21.89■■□□□ 1.09
COL5A3-201ENST00000264828 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
COL5A3-201ENST00000264828 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
COL5A3-201ENST00000264828 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
COL5A3-201ENST00000264828 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.88■■□□□ 1.09
COL5A3-201ENST00000264828 EVC2Q86UK5 1308 aa21.88■■□□□ 1.09
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COL5A3-201ENST00000264828 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.88■■□□□ 1.09
COL5A3-201ENST00000264828 IGF1RP08069 1367 aa21.88■■□□□ 1.09
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COL5A3-201ENST00000264828 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.87■■□□□ 1.09
COL5A3-201ENST00000264828 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.87■■□□□ 1.09
COL5A3-201ENST00000264828 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.87■■□□□ 1.09
COL5A3-201ENST00000264828 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.87■■□□□ 1.09
COL5A3-201ENST00000264828 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
COL5A3-201ENST00000264828 RIPK4P57078 832 aa21.86■■□□□ 1.09
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COL5A3-201ENST00000264828 LNPKQ9C0E8 428 aa21.85■■□□□ 1.09
COL5A3-201ENST00000264828 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.85■■□□□ 1.09
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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COL5A3-201ENST00000264828 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
COL5A3-201ENST00000264828 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
COL5A3-201ENST00000264828 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
COL5A3-201ENST00000264828 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.83■■□□□ 1.09
COL5A3-201ENST00000264828 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.83■■□□□ 1.09
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COL5A3-201ENST00000264828 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.83■■□□□ 1.08
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COL5A3-201ENST00000264828 NFKBIBQ15653 356 aa21.82■■□□□ 1.08
COL5A3-201ENST00000264828 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
COL5A3-201ENST00000264828 MNS1Q8NEH6 495 aa21.82■■□□□ 1.08
COL5A3-201ENST00000264828 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
COL5A3-201ENST00000264828 RNF20Q5VTR2 975 aa21.81■■□□□ 1.08
COL5A3-201ENST00000264828 KIF21BO75037 1637 aa21.81■■□□□ 1.08
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COL5A3-201ENST00000264828 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.79■■□□□ 1.08
COL5A3-201ENST00000264828 PANK1Q8TE04 598 aa21.79■■□□□ 1.08
COL5A3-201ENST00000264828 MSH5O43196 834 aa21.79■■□□□ 1.08
COL5A3-201ENST00000264828 RNF214Q8ND24 703 aa21.79■■□□□ 1.08
COL5A3-201ENST00000264828 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.78■■□□□ 1.08
COL5A3-201ENST00000264828 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
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