RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 MSNP26038 577 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 PDE4AP27815 886 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 CDCA7LQ96GN5 454 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 NGEFQ8N5V2 710 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 GORABQ5T7V8 394 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 ABCC5O15440 1437 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 COG6Q9Y2V7 657 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 COG3Q96JB2 828 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 TAF7LQ5H9L4 462 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 ARHGEF11O15085 1522 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 CHMP3Q9Y3E7 222 aa15.08■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.08■□□□□ 0
PTPRS-201ENST00000262963 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.08■□□□□ 0
PTPRS-201ENST00000262963 DRC7Q8IY82 874 aa15.08■□□□□ 0
PTPRS-201ENST00000262963 GRIN2AQ12879 1464 aa15.07■□□□□ 0
PTPRS-201ENST00000262963 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa15.07■□□□□ 0
PTPRS-201ENST00000262963 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PTPRS-201ENST00000262963 PPP2R1AP30153 589 aa15.06■□□□□ 0
PTPRS-201ENST00000262963 PTPRKQ15262 1439 aa15.06■□□□□ 0
PTPRS-201ENST00000262963 GGNBP2Q9H3C7 697 aa15.05■□□□□ 0
PTPRS-201ENST00000262963 CABP2Q9NPB3 220 aa15.05■□□□□ 0
PTPRS-201ENST00000262963 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
PTPRS-201ENST00000262963 NCOA1Q15788 1441 aa15.05■□□□□ -0
PTPRS-201ENST00000262963 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.04■□□□□ -0
PTPRS-201ENST00000262963 FANCIQ9NVI1 1328 aa15.04■□□□□ -0
PTPRS-201ENST00000262963 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PTPRS-201ENST00000262963 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.03■□□□□ -0
PTPRS-201ENST00000262963 MTHFSP49914 203 aa15.03■□□□□ -0
PTPRS-201ENST00000262963 RUNDC1Q96C34 613 aa15.03■□□□□ -0
PTPRS-201ENST00000262963 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PTPRS-201ENST00000262963 ST18O60284 1047 aa15.03■□□□□ -0
PTPRS-201ENST00000262963 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PTPRS-201ENST00000262963 SLC4A3P48751 1232 aa15.03■□□□□ -0
PTPRS-201ENST00000262963 FAM161AQ3B820 660 aa15.03■□□□□ -0
PTPRS-201ENST00000262963 AKNAQ7Z591 1439 aa15.02■□□□□ -0
PTPRS-201ENST00000262963 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa15.02■□□□□ -0
PTPRS-201ENST00000262963 KIAA2012Q0VF49 1180 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 TEFQ10587 303 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 CCDC34Q96HJ3 373 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 RIPK4P57078 832 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 C1orf141Q5JVX7 400 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 MAPKBP1O60336 1514 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 KIF3AQ9Y496 699 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 RAPGEF3O95398 923 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD45Q5TZF3 282 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 TCP11L2Q8N4U5 519 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 PANK1Q8TE04 598 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 ERBINQ96RT1 1412 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 KIF16BQ96L93 1317 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 HMOX1P09601 288 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 TPM4P67936 248 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 USP35Q9P2H5 1018 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 RILPL2Q969X0 211 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 PRAM1Q96QH2 718 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 PHF14O94880 888 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 CLSTN1O94985 981 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 GNAI1P63096 354 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 TOMM22Q9NS69 142 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 BCAR3O75815 825 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 REC8O95072 547 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 PSME1Q06323 249 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 EVA1CP58658 441 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms