RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 TNNQ9UQP3 1299 aa11.43□□□□□ -0.58
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GINS1-201ENST00000262460 RAPGEF3O95398 923 aa11.43□□□□□ -0.58
GINS1-201ENST00000262460 DUSP27Q5VZP5 1158 aa11.43□□□□□ -0.58
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GINS1-201ENST00000262460 ATP10AO60312 1499 aa11.41□□□□□ -0.58
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GINS1-201ENST00000262460 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
GINS1-201ENST00000262460 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa11.32□□□□□ -0.6
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GINS1-201ENST00000262460 ASXL2Q76L83 1435 aa11.32□□□□□ -0.6
GINS1-201ENST00000262460 GGNBP2Q9H3C7 697 aa11.31□□□□□ -0.6
GINS1-201ENST00000262460 ZNF521Q96K83 1311 aa11.31□□□□□ -0.6
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GINS1-201ENST00000262460 MLECQ14165 292 aa11.3□□□□□ -0.6
GINS1-201ENST00000262460 WWC1Q8IX03 1113 aa11.3□□□□□ -0.6
GINS1-201ENST00000262460 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
GINS1-201ENST00000262460 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.6
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GINS1-201ENST00000262460 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa11.29□□□□□ -0.6
GINS1-201ENST00000262460 KDM2BQ8NHM5 1336 aa11.28□□□□□ -0.6
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GINS1-201ENST00000262460 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa11.28□□□□□ -0.6
GINS1-201ENST00000262460 IL27Q8NEV9 243 aa11.28□□□□□ -0.6
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GINS1-201ENST00000262460 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.61
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GINS1-201ENST00000262460 IQGAP1P46940 1657 aa11.25□□□□□ -0.61
GINS1-201ENST00000262460 ABCA6Q8N139 1617 aa11.24□□□□□ -0.61
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GINS1-201ENST00000262460 MYOM1P52179 1685 aa11.24□□□□□ -0.61
GINS1-201ENST00000262460 E9PSI1 815 aa11.23□□□□□ -0.61
GINS1-201ENST00000262460 NUTM2FA1L443 756 aa11.23□□□□□ -0.61
GINS1-201ENST00000262460 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
GINS1-201ENST00000262460 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
GINS1-201ENST00000262460 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
GINS1-201ENST00000262460 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa11.23□□□□□ -0.61
GINS1-201ENST00000262460 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
GINS1-201ENST00000262460 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
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