RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249356.3

DNAJB9-201, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DNAJB9, Length 2,715 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB9-201ENST00000249356 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.54■□□□□ 0.88
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DNAJB9-201ENST00000249356 SLC24A1O60721 1099 aa20.53■□□□□ 0.88
DNAJB9-201ENST00000249356 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
DNAJB9-201ENST00000249356 NUP160Q12769 1436 aa20.53■□□□□ 0.88
DNAJB9-201ENST00000249356 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.53■□□□□ 0.88
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DNAJB9-201ENST00000249356 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
DNAJB9-201ENST00000249356 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.3■□□□□ 0.84
DNAJB9-201ENST00000249356 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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DNAJB9-201ENST00000249356 AAMPQ13685 434 aa20.24■□□□□ 0.83
DNAJB9-201ENST00000249356 NEUROD2Q15784 382 aa20.24■□□□□ 0.83
DNAJB9-201ENST00000249356 WWC1Q8IX03 1113 aa20.24■□□□□ 0.83
DNAJB9-201ENST00000249356 NGEFQ8N5V2 710 aa20.24■□□□□ 0.83
DNAJB9-201ENST00000249356 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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DNAJB9-201ENST00000249356 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.17■□□□□ 0.82
DNAJB9-201ENST00000249356 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.17■□□□□ 0.82
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DNAJB9-201ENST00000249356 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
DNAJB9-201ENST00000249356 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.16■□□□□ 0.82
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DNAJB9-201ENST00000249356 CEP152O94986 1710 aa20.16■□□□□ 0.82
DNAJB9-201ENST00000249356 CLTCL1P53675 1640 aa20.16■□□□□ 0.82
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