RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 IFT172Q9UG01 1749 aa23.46■■□□□ 1.35
TVP23C-201ENST00000225576 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.44■■□□□ 1.34
TVP23C-201ENST00000225576 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.44■■□□□ 1.34
TVP23C-201ENST00000225576 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.44■■□□□ 1.34
TVP23C-201ENST00000225576 ZMYM3Q14202 1370 aa23.44■■□□□ 1.34
TVP23C-201ENST00000225576 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.44■■□□□ 1.34
TVP23C-201ENST00000225576 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.43■■□□□ 1.34
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TVP23C-201ENST00000225576 PIK3C2GO75747 1445 aa23.37■■□□□ 1.33
TVP23C-201ENST00000225576 ZFYVE9O95405 1425 aa23.37■■□□□ 1.33
TVP23C-201ENST00000225576 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.37■■□□□ 1.33
TVP23C-201ENST00000225576 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.36■■□□□ 1.33
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TVP23C-201ENST00000225576 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.34■■□□□ 1.33
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TVP23C-201ENST00000225576 TESK2Q96S53 571 aa23.33■■□□□ 1.32
TVP23C-201ENST00000225576 IQGAP1P46940 1657 aa23.32■■□□□ 1.32
TVP23C-201ENST00000225576 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.31■■□□□ 1.32
TVP23C-201ENST00000225576 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.31■■□□□ 1.32
TVP23C-201ENST00000225576 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
TVP23C-201ENST00000225576 TNRQ92752 1358 aa23.29■■□□□ 1.32
TVP23C-201ENST00000225576 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.28■■□□□ 1.32
TVP23C-201ENST00000225576 TMF1P82094 1093 aa23.25■■□□□ 1.31
TVP23C-201ENST00000225576 SLC24A1O60721 1099 aa23.24■■□□□ 1.31
TVP23C-201ENST00000225576 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.24■■□□□ 1.31
TVP23C-201ENST00000225576 ADGRB1O14514 1584 aa23.24■■□□□ 1.31
TVP23C-201ENST00000225576 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TVP23C-201ENST00000225576 CCER2I3L3R5 266 aa23.23■■□□□ 1.31
TVP23C-201ENST00000225576 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.23■■□□□ 1.31
TVP23C-201ENST00000225576 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.2■■□□□ 1.31
TVP23C-201ENST00000225576 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.2■■□□□ 1.3
TVP23C-201ENST00000225576 NLRP1Q9C000 1473 aa23.19■■□□□ 1.3
TVP23C-201ENST00000225576 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
TVP23C-201ENST00000225576 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
TVP23C-201ENST00000225576 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.18■■□□□ 1.3
TVP23C-201ENST00000225576 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
TVP23C-201ENST00000225576 CDCA8Q53HL2 280 aa23.18■■□□□ 1.3
TVP23C-201ENST00000225576 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
TVP23C-201ENST00000225576 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.17■■□□□ 1.3
TVP23C-201ENST00000225576 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.16■■□□□ 1.3
TVP23C-201ENST00000225576 C3P01024 1663 aa23.15■■□□□ 1.3
TVP23C-201ENST00000225576 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.14■■□□□ 1.3
TVP23C-201ENST00000225576 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.13■■□□□ 1.29
TVP23C-201ENST00000225576 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
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TVP23C-201ENST00000225576 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.11■■□□□ 1.29
TVP23C-201ENST00000225576 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.11■■□□□ 1.29
TVP23C-201ENST00000225576 ALKQ9UM73 1620 aa23.1■■□□□ 1.29
TVP23C-201ENST00000225576 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.09■■□□□ 1.29
TVP23C-201ENST00000225576 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.09■■□□□ 1.29
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TVP23C-201ENST00000225576 PTPRMP28827 1452 aa23.02■■□□□ 1.28
TVP23C-201ENST00000225576 PANK3Q9H999 370 aa23.02■■□□□ 1.28
TVP23C-201ENST00000225576 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
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TVP23C-201ENST00000225576 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 STK26Q9P289 416 aa23■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 SLIT1O75093 1534 aa23■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.99■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.99■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.98■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 EID1Q9Y6B2 187 aa22.98■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 ABCC11Q96J66 1382 aa22.97■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 LTKP29376 864 aa22.97■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 RALBP1Q15311 655 aa22.97■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.97■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 DLC1Q96QB1 1528 aa22.96■■□□□ 1.27
TVP23C-201ENST00000225576 EVC2Q86UK5 1308 aa22.95■■□□□ 1.26
TVP23C-201ENST00000225576 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TVP23C-201ENST00000225576 PRAM1Q96QH2 718 aa22.93■■□□□ 1.26
TVP23C-201ENST00000225576 POGKQ9P215 609 aa22.93■■□□□ 1.26
TVP23C-201ENST00000225576 METP08581 1390 aa22.93■■□□□ 1.26
TVP23C-201ENST00000225576 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.92■■□□□ 1.26
TVP23C-201ENST00000225576 MYOM1P52179 1685 aa22.92■■□□□ 1.26
TVP23C-201ENST00000225576 SIRT1Q96EB6 747 aa22.92■■□□□ 1.26
TVP23C-201ENST00000225576 BCANQ96GW7 911 aa22.92■■□□□ 1.26
TVP23C-201ENST00000225576 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TVP23C-201ENST00000225576 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.9■■□□□ 1.26
TVP23C-201ENST00000225576 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.9■■□□□ 1.26
TVP23C-201ENST00000225576 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.9■■□□□ 1.26
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC184Q52MB2 194 aa22.89■■□□□ 1.26
TVP23C-201ENST00000225576 TECPR2O15040 1411 aa22.89■■□□□ 1.25
TVP23C-201ENST00000225576 MED14O60244 1454 aa22.89■■□□□ 1.25
TVP23C-201ENST00000225576 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.254e-8■■□□□ 13.7
TVP23C-201ENST00000225576 MRS2Q9HD23 443 aa22.88■■□□□ 1.25
TVP23C-201ENST00000225576 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
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