RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXA11-201ENST00000006015 FAM161AQ3B820 660 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXA11-201ENST00000006015 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXA11-201ENST00000006015 KIF3BO15066 747 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXA11-201ENST00000006015 SLC4A3P48751 1232 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXA11-201ENST00000006015 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXA11-201ENST00000006015 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXA11-201ENST00000006015 ASXL2Q76L83 1435 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXA11-201ENST00000006015 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXA11-201ENST00000006015 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXA11-201ENST00000006015 C8orf34Q49A92 452 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXA11-201ENST00000006015 ADGRL1O94910 1474 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXA11-201ENST00000006015 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
HOXA11-201ENST00000006015 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXA11-201ENST00000006015 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXA11-201ENST00000006015 ATP7AQ04656 1500 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXA11-201ENST00000006015 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXA11-201ENST00000006015 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXA11-201ENST00000006015 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXA11-201ENST00000006015 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXA11-201ENST00000006015 PANK3Q9H999 370 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXA11-201ENST00000006015 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
HOXA11-201ENST00000006015 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
HOXA11-201ENST00000006015 OSCARQ8IYS5 282 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXA11-201ENST00000006015 TMF1P82094 1093 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXA11-201ENST00000006015 LAMC1P11047 1609 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXA11-201ENST00000006015 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
HOXA11-201ENST00000006015 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
HOXA11-201ENST00000006015 PTPRTO14522 1441 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXA11-201ENST00000006015 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
HOXA11-201ENST00000006015 KANK1Q14678 1352 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXA11-201ENST00000006015 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.53■■□□□ 1.68
HOXA11-201ENST00000006015 TRPM2O94759 1503 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXA11-201ENST00000006015 CLTCL1P53675 1640 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXA11-201ENST00000006015 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
HOXA11-201ENST00000006015 DEPDC5O75140 1603 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXA11-201ENST00000006015 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXA11-201ENST00000006015 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXA11-201ENST00000006015 MADDQ8WXG6 1647 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXA11-201ENST00000006015 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXA11-201ENST00000006015 TET3O43151 1660 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXA11-201ENST00000006015 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
HOXA11-201ENST00000006015 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXA11-201ENST00000006015 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
HOXA11-201ENST00000006015 CEP152O94986 1710 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXA11-201ENST00000006015 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXA11-201ENST00000006015 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXA11-201ENST00000006015 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXA11-201ENST00000006015 RGS3P49796 1198 aa25.42■■□□□ 1.66
HOXA11-201ENST00000006015 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXA11-201ENST00000006015 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXA11-201ENST00000006015 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF521Q96K83 1311 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXA11-201ENST00000006015 GGT6Q6P531 493 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXA11-201ENST00000006015 CD109Q6YHK3 1445 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXA11-201ENST00000006015 GOLGA2Q08379 1002 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXA11-201ENST00000006015 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXA11-201ENST00000006015 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXA11-201ENST00000006015 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXA11-201ENST00000006015 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
HOXA11-201ENST00000006015 IQGAP1P46940 1657 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXA11-201ENST00000006015 RAPGEF3O95398 923 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXA11-201ENST00000006015 BECN1Q14457 450 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXA11-201ENST00000006015 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXA11-201ENST00000006015 STAC3Q96MF2 364 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXA11-201ENST00000006015 USP19O94966 1318 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXA11-201ENST00000006015 POGKQ9P215 609 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXA11-201ENST00000006015 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
HOXA11-201ENST00000006015 SLFN5Q08AF3 891 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXA11-201ENST00000006015 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXA11-201ENST00000006015 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
HOXA11-201ENST00000006015 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXA11-201ENST00000006015 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXA11-201ENST00000006015 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXA11-201ENST00000006015 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXA11-201ENST00000006015 PPP2R1AP30153 589 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXA11-201ENST00000006015 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXA11-201ENST00000006015 CDCA8Q53HL2 280 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 NLRP1Q9C000 1473 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 PIK3C2GO75747 1445 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 NPATQ14207 1427 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 MROH2AA6NES4 1674 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 NOS1P29475 1434 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 ABCA6Q8N139 1617 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 KIF1BO60333 1816 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 SYNMO15061 1565 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 MYOM2P54296 1465 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXA11-201ENST00000006015 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXA11-201ENST00000006015 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXA11-201ENST00000006015 IGHDP01880 384 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXA11-201ENST00000006015 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.5 ms