RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.69■■□□□ 1.7
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HOXA11-201ENST00000006015 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXA11-201ENST00000006015 KIF3BO15066 747 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXA11-201ENST00000006015 SLC4A3P48751 1232 aa25.68■■□□□ 1.7
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HOXA11-201ENST00000006015 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.67■■□□□ 1.7
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HOXA11-201ENST00000006015 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
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HOXA11-201ENST00000006015 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.46■■□□□ 1.67
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HOXA11-201ENST00000006015 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
HOXA11-201ENST00000006015 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.44■■□□□ 1.66
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HOXA11-201ENST00000006015 CEP152O94986 1710 aa25.43■■□□□ 1.66
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HOXA11-201ENST00000006015 ZNF521Q96K83 1311 aa25.41■■□□□ 1.66
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HOXA11-201ENST00000006015 USP19O94966 1318 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXA11-201ENST00000006015 POGKQ9P215 609 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXA11-201ENST00000006015 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
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HOXA11-201ENST00000006015 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXA11-201ENST00000006015 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
HOXA11-201ENST00000006015 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXA11-201ENST00000006015 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXA11-201ENST00000006015 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXA11-201ENST00000006015 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXA11-201ENST00000006015 PPP2R1AP30153 589 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXA11-201ENST00000006015 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXA11-201ENST00000006015 CDCA8Q53HL2 280 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 NLRP1Q9C000 1473 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 PIK3C2GO75747 1445 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 NPATQ14207 1427 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 MROH2AA6NES4 1674 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 NOS1P29475 1434 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 ABCA6Q8N139 1617 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 KIF1BO60333 1816 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 SYNMO15061 1565 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 MYOM2P54296 1465 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA11-201ENST00000006015 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXA11-201ENST00000006015 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXA11-201ENST00000006015 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXA11-201ENST00000006015 IGHDP01880 384 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXA11-201ENST00000006015 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
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