RNA–Protein interactions for RNA: YML071C

COG8, Transcript of Component of the conserved oligomeric Golgi complex, yeast

Gene COG8, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COG8	YML071C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	YPL229W	Q99395	206 aa		0.2	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	YSR3	P23501	404 aa		0.19	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	MSA2	P36157	363 aa		0.19	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	HSM3	P38348	480 aa		0.19	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	SIP3	P38717	1229 aa		0.19	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	FIS1	P40515	155 aa		0.19	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	CUR1	Q06469	252 aa		0.19	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	ARR2	Q06597	130 aa		0.19	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	YHR180W	P38868	163 aa		0.18	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	YER076C	P40049	302 aa		0.18	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	GTR2	P53290	341 aa		0.18	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	YNL260C	P53846	198 aa		0.18	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	ABZ2	Q03266	374 aa		0.18	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	GOT1	Q03554	138 aa		0.18	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	ARV1	Q06541	321 aa		0.18	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	HEM25	Q07534	307 aa		0.18	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	BPH1	P25356	2167 aa		0.18	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	SWI1	P09547	1314 aa		0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	YEL067C	P39978	195 aa		0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	TIR3	P40552	269 aa		0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	MRX5	P47007	382 aa		0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	RMR1	P53060	241 aa		0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	YGL159W	P53110	370 aa		0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	YGL034C	P53186	121 aa		0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	CDC14	Q00684	551 aa		0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	YML096W	Q04489	525 aa		0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	YPL257W	Q08974	193 aa		0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	MYO1	P08964	1928 aa		0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	MRH4	P53166	561 aa		0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	ATG39	Q06159	398 aa		0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	YLR030W	Q07967	263 aa		0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	TPO4	Q12256	659 aa		0.17	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	YLR422W	Q06409	1932 aa		0.16	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	VPS3	P23643	1011 aa		0.16	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	SPO19	Q03029	223 aa		0.16	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	FZF1	P32805	299 aa		0.15	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	OSW5	P40219	148 aa		0.15	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	DSN1	P40568	576 aa		0.15	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	YJR012C	P47087	207 aa		0.15	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	NUP84	P52891	726 aa		0.15	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	GRX8	Q05926	109 aa		0.15	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	ATG17	Q06410	417 aa		0.15	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	SNF8	Q12483	233 aa		0.15	□□□□□ -2.38
COG8	YML071C	BLM10	P43583	2143 aa		0.15	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.15	□□□□□ -2.39	not detected
COG8	YML071C	MRX3	P38172	270 aa		0.15	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	YNL217W	P40152	326 aa		0.15	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	LSB1	P53281	241 aa		0.15	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	RRF1	P38771	230 aa		0.14	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	SAY1	P53324	424 aa		0.14	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	FMN1	Q03778	218 aa		0.14	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	ERV41	Q04651	352 aa		0.14	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	ANT1	Q06497	328 aa		0.14	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	YOR342C	Q12182	319 aa		0.14	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	YCT1	Q12235	531 aa		0.14	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		0.14	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	MEI4	P29467	408 aa		0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	YKL070W	P36087	169 aa		0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	TVP38	P36164	337 aa		0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	BIG1	P38813	335 aa		0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	YJR056C	P47115	236 aa		0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	BOL2	P53082	120 aa		0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	YMR321C	Q04898	105 aa		0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	YPR172W	Q06608	200 aa		0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	YKR104W	P0CE69	306 aa		0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	PBN1	P25580	416 aa		0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	MRPL39	P36533	70 aa		0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	YAR068W	P39564	161 aa		0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	DDI1	P40087	428 aa		0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	MEP1	P40260	492 aa		0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	SOK1	P40317	901 aa		0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	GPI8	P49018	411 aa		0.13	□□□□□ -2.39
COG8	YML071C	PGC1	Q08959	321 aa		0.13	□□□□□ -2.39

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