RNA–Protein interactions for RNA: YML013W

UBX2, Transcript of Bridging factor involved in ER-associated protein degradation (ERAD), yeast

Gene UBX2, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX2	YML013W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	PUT1	P09368	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	SKN1	P33336	771 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	MRP21	P38175	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	AME1	P38313	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	CHL4	P38907	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	HAT2	P39984	401 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	GWT1	P47026	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	IRC15	Q02733	499 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	NAT4	Q04751	285 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	LDS2	Q08218	356 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	MMT2	Q08970	484 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	PET20	Q99373	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	QCR7	P00128	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	PPH21	P23594	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	IES6	P32617	166 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	CBP4	P37267	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	BDH1	P39714	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	SYS1	P41544	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	SHY1	P53266	389 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	CDC14	Q00684	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	IRC13	Q08630	104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	MRPS5	P33759	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	RIB5	P38145	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	CUE1	P38428	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	ARP1	P38696	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	PMT6	P42934	759 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	IGO1	P53897	168 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	AVO2	Q04749	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	PEX30	Q06169	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	PER33	Q12144	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	TPO4	Q12256	659 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	PHO2	P07269	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	TRS65	P32893	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	MNS1	P32906	549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	TIP20	P33891	701 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	OMA1	P36163	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	FIG1	P38224	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YEL028W	P39989	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YIL152W	P40455	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	MGA1	P53050	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YIP3	P53633	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	UPS3	Q04006	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	TMN2	Q04562	672 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	ATG39	Q06159	398 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	KEI1	Q06346	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	PIN3	Q06449	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	HEM25	Q07534	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	ATG10	Q07879	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	IES4	Q08561	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	QCR2	P07257	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	PRY2	P36110	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YER121W	P40076	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YIR016W	P40572	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	FLC3	P53121	802 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	CTF19	Q02732	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	HRD1	Q08109	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	NAT5	Q08689	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	SUT2	Q12286	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	SEC17	P32602	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YPT53	P36019	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YAL037W	P39728	267 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	SHO1	P40073	367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YER188W	P40103	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	APJ1	P53940	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	YML096W	Q04489	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	BSP1	Q06604	576 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	RPB8	P20436	146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	LSB5	P25369	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	STP22	P25604	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBX2	YML013W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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