RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W COG5P53951 403 aa3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YDR476CQ03362 224 aa3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W AIM34Q03673 198 aa3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YML108WQ03759 105 aa3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W UTP15Q04305 513 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W EMI1Q04406 187 aa3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YMR254CQ04838 102 aa3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W DYN3Q04949 312 aa3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W FSH2Q05015 223 aa3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W FAR10Q06001 478 aa3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W BBP1Q12365 385 aa3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YDL199CQ12407 687 aa3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W HHF1P02309 103 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W MRS1P07266 363 aa3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W NHP6AP11632 93 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W ATR1P13090 542 aa3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W EPT1P22140 391 aa3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W AAT2P23542 418 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W SEC14P24280 304 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YCL042WP25572 119 aa3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YCR022CP25620 114 aa3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W CLG1P35190 452 aa3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W RCK1P38622 512 aa3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W ECM14P38836 430 aa3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W LSM4P40070 187 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W MDV1P47025 714 aa3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W CLD1P53264 445 aa3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W RSC9Q03124 581 aa3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YPR127WQ06494 345 aa3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W OCA6Q12454 224 aa3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W DDP1Q99321 188 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YET1P35723 206 aa3.43□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W PMU1P36069 295 aa3.43□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YBR137WP38276 179 aa3.43□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W FLO5P38894 1075 aa3.43□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W OXA1P39952 402 aa3.43□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YIL024CP40543 189 aa3.43□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W FMP32P43557 207 aa3.43□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W FAR7P43592 221 aa3.43□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W SYF2P53277 215 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W TIM13P53299 105 aa3.43□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W PKR1Q03880 122 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YPD1Q07688 167 aa3.43□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W LDB18Q07887 179 aa3.43□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W STE7P06784 515 aa3.42□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W CPA1P07258 411 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W GRX2P17695 143 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W AIM17P23180 465 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W TCA17P32613 152 aa3.42□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W CAT2P32796 670 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W SRY1P36007 326 aa3.42□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YKR041WP36134 250 aa3.42□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W CHL4P38907 458 aa3.42□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W SEN34P39707 275 aa3.42□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W BDH1P39714 382 aa3.42□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YFL067WP43537 175 aa3.42□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W ILM1P47155 203 aa3.42□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W TOS8P53147 276 aa3.42□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W MPA43P53583 542 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W GOT1Q03554 138 aa3.42□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YOR292CQ08743 309 aa3.42□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W CDC8P00572 216 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W UBC8P28263 218 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W OAC1P32332 324 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W APS1P35181 156 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W MBA1P38300 278 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YHL049CP38722 271 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W AIM18P38884 321 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W MEP2P41948 499 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W BUD13P46947 266 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W NCA3P46955 337 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W AIM25P47140 327 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W MRH4P53166 561 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YGL034CP53186 121 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W TPC1P53257 314 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W SHY1P53266 389 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W ADD37Q03233 198 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W SDC1Q03323 175 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YDR124WQ04608 324 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YOL019WQ08157 551 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YPL257WQ08974 193 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W THP3Q12049 470 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W ATP16Q12165 160 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W CRC1Q12289 327 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W RAX2Q12465 1220 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W MHT1Q12525 324 aa3.41□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W RPL25P04456 142 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W SNF4P12904 322 aa3.4□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W CPR1P14832 162 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W RPB5P20434 215 aa3.4□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W CDC50P25656 391 aa3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.1 ms