RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	SPT3	P06844	337 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	RPO26	P20435	155 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	TFC1	P32367	649 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	SNC2	P33328	115 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	SKG1	P36169	355 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	UMP1	P38293	148 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	PRM8	P53174	237 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	SWP1	Q02795	286 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	YLR283W	Q05867	314 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	PDR18	P53756	1333 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	URA6	P15700	204 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	SSO1	P32867	290 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	MSN4	P33749	630 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	TVP38	P36164	337 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	MRPL17	P36528	281 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	YBR209W	P38311	105 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	COX15	P40086	486 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	RPC17	P47076	161 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	EAF6	P47128	113 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.55	□□□□□ -2.32	not detected
YJL135W	YJL135W	FYV6	P53913	173 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	RRN5	Q02983	363 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	GAS3	Q03655	524 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	CDC123	Q05791	360 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	YDL180W	Q12301	547 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	TIM9	O74700	87 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	SRY1	P36007	326 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	BXI1	P48558	297 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	BRR6	P53062	197 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	GPM2	Q12008	311 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	MSB2	P32334	1306 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	DBF2	P22204	572 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	APS1	P35181	156 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	YEL067C	P39978	195 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	FAR7	P43592	221 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	MIC26	P50087	233 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	KNH1	P50112	268 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	ATG40	Q99325	256 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YJL135W	YJL135W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.52	□□□□□ -2.33	not detected
YJL135W	YJL135W	YBR285W	P38354	144 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	RMD6	P39975	231 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	ALG13	P53178	202 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	AIM36	Q03798	255 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	MCP1	Q12106	302 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	YIL177C	P40434	1758 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	YJL225C	P40889	1758 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	SIR2	P06700	562 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	KSS1	P14681	368 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	YMR31	P19955	123 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	BET1	P22804	142 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	PBN1	P25580	416 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	PPA2	P28239	310 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	SEC17	P32602	292 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	TCA17	P32613	152 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	PTM1	P32857	523 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	OPY1	P38271	328 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	MIC12	P38341	106 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	YER085C	P40058	173 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	FLX1	P40464	311 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	YDR274C	P87283	123 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	AQY2	P0CD90	149 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	SEC11	P15367	167 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	SIP3	P38717	1229 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	YHL042W	P38729	150 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	HUA1	P40325	198 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	YFL065C	P43539	102 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	RCE1	Q03530	315 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YJL135W	YJL135W	YDR249C	Q03787	373 aa		0.5	□□□□□ -2.33

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