RNA–Protein interactions for RNA: YHR050W

SMF2, Transcript of Divalent metal ion transporter involved in manganese homeostasis, yeast

Gene SMF2, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMF2	YHR050W	PAU15	P40585	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	CTK2	P46962	323 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	TAX4	P47030	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	MSY1	P48527	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	RSM23	Q01163	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	TRS23	Q03784	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	MIX14	Q04341	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	HOF1	Q05080	669 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	RTT103	Q05543	409 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	MHR1	Q06630	226 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	MED7	Q08278	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	VAM3	Q12241	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	COX19	Q3E731	98 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	HFA1	P32874	2273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	COX5B	P00425	151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	MDH2	P22133	377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	PCL1	P24867	279 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	YER158C	P40095	573 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	UBP8	P50102	471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	RSM10	Q03201	203 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	TMA23	Q03525	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	RIB5	P38145	238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	YBR096W	P38256	230 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	MOB2	P43563	287 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	YGL114W	P53134	725 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	YNR048W	P53740	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	HHT1	P61830	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	NRG1	Q03125	231 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	NUP53	Q03790	475 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	UBA3	Q99344	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
SMF2	YHR050W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	LAC1	P28496	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	MRPL28	P36527	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	PIC2	P40035	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	RTS2	P40962	232 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	ECO1	P43605	281 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	UFD1	P53044	361 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	PCP1	P53259	346 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	HOL1	P53389	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	CTR3	Q06686	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	QCR2	P07257	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	CDC50	P25656	391 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	AGA2	P32781	87 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	AFR1	P33304	620 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	FAT1	P38225	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	YEA6	P39953	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	YEA4	P40004	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	YND1	P40009	630 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	ATF1	P40353	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	FLX1	P40464	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	MGA1	P53050	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	ADD37	Q03233	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	THI74	Q04083	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	ASM4	Q05166	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	TMA10	Q06177	86 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	TRS20	P38334	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	UME6	P39001	836 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	GET2	P40056	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	GWT1	P47026	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	BNS1	P50084	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	YGL185C	P53100	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	AVO2	Q04749	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	THI72	Q08579	599 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	YCT1	Q12235	531 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	FLO9	P39712	1322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	CKA1	P15790	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	POP5	P28005	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	YKL069W	P36088	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	FIG1	P38224	298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	UBS1	P38290	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	SUR2	P38992	349 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	IRC24	P40580	263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMF2	YHR050W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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