RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	FLO5	P38894	1075 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YIL024C	P40543	189 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	COQ5	P49017	307 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	HST4	P53688	370 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	AAH1	P53909	347 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	MRX11	Q03079	207 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	SCO1	P23833	295 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	DOG2	P38773	246 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	DOG1	P38774	246 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	CHS7	P38843	316 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	RMD6	P39975	231 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	CCC1	P47818	322 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YGL034C	P53186	121 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	PHO2	P07269	559 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	MRS3	P10566	314 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YCR025C	P25352	136 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	OAR1	P35731	278 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	XBP1	P40489	647 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YPL113C	Q02961	396 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	SUE1	Q06524	206 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YFL064C	P43540	174 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YGR018C	P53211	109 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YDR476C	Q03362	224 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	GOT1	Q03554	138 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YDR124W	Q04608	324 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	SHH4	Q06236	168 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YOL160W	Q08321	113 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YPR202W	Q08993	238 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	AYT1	Q12226	474 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YHR139C-A	O13536	103 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	TRP1	P00912	224 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	SNF4	P12904	322 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	CDC50	P25656	391 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	EFM1	P38732	585 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YJL213W	P40896	331 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	CLD1	P53264	445 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	RAV2	Q03956	351 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YPL278C	Q08990	100 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	CRC1	Q12289	327 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	RIB3	Q99258	208 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	LYS2	P07702	1392 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	MSI1	P13712	422 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	RNQ1	P25367	405 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	CSG2	P35206	410 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	POP8	P38208	133 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	TRR2	P38816	342 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	NCA3	P46955	337 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	MRPS28	P21771	286 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	MOH1	P38191	138 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	OPY1	P38271	328 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	ERV29	P53337	310 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YDR249C	Q03787	373 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YLR177W	Q06251	628 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	SIR2	P06700	562 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	RPB5	P20434	215 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	TVP38	P36164	337 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	RPR2	P40571	144 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	UBC7	Q02159	165 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YML108W	Q03759	105 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	VHS1	Q03785	461 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	GPI17	Q04080	534 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	FRQ1	Q06389	190 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	ATG22	P25568	528 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	HSP30	P25619	332 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	ATS1	P31386	333 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	ILM1	P47155	203 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	TRM12	Q04235	462 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	NEJ1	Q06148	342 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	CNB1	P25296	175 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	IMP1	P28627	190 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	YDR416W	PTM1	P32857	523 aa		3.42	□□□□□ -1.86

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