RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W YPD1Q07688 167 aa4.75□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W ORT1Q12375 292 aa4.75□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W CMC2Q3E7A4 109 aa4.75□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W CCH1P50077 2039 aa4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W URA6P15700 204 aa4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W RPB3P16370 318 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W IFM1P25038 676 aa4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W CPR4P25334 318 aa4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W FAA1P30624 700 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data4.74□□□□□ -1.65not detected
VHS1YDR247W FMT1P32785 401 aa4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W PTR2P32901 601 aa4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W MNL1P38888 796 aa4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W VMA21P41806 77 aa4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W GNA1P43577 159 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W DAN1P47178 298 aa4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W SOL1P50278 321 aa4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W AAH1P53909 347 aa4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W AQR1P53943 586 aa4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W GPI15P53961 229 aa4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W ACT1P60010 375 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W HEM25Q07534 307 aa4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W PML1Q07930 204 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W RAD28Q12021 506 aa4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W MED4Q12343 284 aa4.74□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W ILV5P06168 395 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W MATALPHA1P0CY06 175 aa4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W HMLALPHA1P0CY07 175 aa4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YCR043CP25361 127 aa4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W SPT10P35208 640 aa4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YKL071WP36086 256 aa4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W SHO1P40073 367 aa4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W IDP2P41939 412 aa4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YJR056CP47115 236 aa4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W ADO1P47143 340 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W BXI1P48558 297 aa4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W PDR16P53860 351 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W APJ1P53940 528 aa4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W FIT1Q04433 528 aa4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YMR253CQ04835 414 aa4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W SYM1Q06563 197 aa4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W HRT1Q08273 121 aa4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W REX3Q12090 404 aa4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YLR146W-AQ2V2P1 62 aa4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W PET20Q99373 253 aa4.73□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W MDM35O60200 86 aa4.72□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W CDC7P06243 507 aa4.72□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W PET18P25362 215 aa4.72□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W LSB5P25369 354 aa4.72□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W TRR1P29509 319 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W MRPL37P36532 105 aa4.72□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W SDH4P37298 181 aa4.72□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W POP8P38208 133 aa4.72□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W QDR3P38227 689 aa4.72□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W PRS2P38620 318 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YER079WP40052 210 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W RFC2P40348 353 aa4.72□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W NAS2P40555 220 aa4.72□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W TIM21P53220 239 aa4.72□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W TPC1P53257 314 aa4.72□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W GEP3Q08622 556 aa4.72□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W ADH3P07246 375 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W SGA1P08019 549 aa4.71□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W SPT15P13393 240 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W POF1P25576 258 aa4.71□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W CLB6P32943 380 aa4.71□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W SSS1P35179 80 aa4.71□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W SHG1P38337 142 aa4.71□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W SLM1P40485 686 aa4.71□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W RPA34P47006 233 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W MTM1P53320 366 aa4.71□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W YLR152CP54072 576 aa4.71□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W BET5Q03630 159 aa4.71□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W YML018CQ03730 393 aa4.71□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W MRX8Q05473 314 aa4.71□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W NNT1Q05874 261 aa4.71□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W COX19Q3E731 98 aa4.71□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W SCL1P21243 252 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W YCR022CP25620 114 aa4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W GLC7P32598 312 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W SNC2P33328 115 aa4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W NTF2P33331 125 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data4.7□□□□□ -1.66not detected
VHS1YDR247W RIB5P38145 238 aa4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W AVT5P38176 459 aa4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W YBR013CP38215 129 aa4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W MED6P38782 295 aa4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W YND1P40009 630 aa4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W SPC25P40014 221 aa4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W LSM4P40070 187 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W OSW5P40219 148 aa4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W DLS1P40366 167 aa4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W YIL067CP40514 678 aa4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W AVT4P50944 713 aa4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W MPA43P53583 542 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
VHS1YDR247W YNR048WP53740 393 aa4.7□□□□□ -1.66
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