RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	FRE2	P36033	711 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	ECM4	P36156	370 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	NAT2	P37293	288 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	GEP4	P38812	185 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	IRC18	P47056	224 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YJR015W	P47090	510 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	GPI8	P49018	411 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	NIF3	P53081	288 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YGL101W	P53144	215 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	INP1	Q03694	420 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RAV2	Q03956	351 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	BNA7	Q04066	261 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YDR114C	Q04597	100 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	PHO92	Q06390	306 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YLR413W	Q06689	675 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	AIM41	Q12032	185 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YCT1	Q12235	531 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YPR1	Q12458	312 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.23	□□□□□ -2.37	not detected
AI1	Q0050	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MSS18	P08593	268 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	ADH4	P10127	382 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YMR31	P19955	123 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	PPA2	P28239	310 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	PEX3	P28795	441 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	TIM12	P32830	109 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RCN1	P36054	211 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YLF2	P38746	405 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	POR2	P40478	281 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	CAT5	P41735	233 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	CTK2	P46962	323 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MRX5	P47007	382 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YJR146W	P47174	117 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MIC26	P50087	233 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	GPG1	P53130	126 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	TWF1	P53250	332 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	CTF19	Q02732	369 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MRPS8	Q03799	155 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	TAF11	Q04226	346 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MRPL35	Q06678	367 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	DAS2	Q12084	232 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	VAM3	Q12241	283 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	KTI11	Q3E840	82 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.23	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	URA3	P03962	267 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.22	□□□□□ -2.37	not detected
AI1	Q0050	ERD2	P18414	219 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SPO13	P23624	291 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	FMT1	P32785	401 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YKR015C	P36111	568 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MED8	P38304	223 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	POP4	P38336	279 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	ERG28	P40030	148 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SWP82	P43554	623 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YJR096W	P47137	282 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MCM22	P47167	239 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	NRK1	P53915	240 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YDR210W	Q03482	75 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SNO4	Q04902	237 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MRX8	Q05473	314 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	CRN1	Q06440	651 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YPD1	Q07688	167 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RRT8	Q08219	342 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	HSP32	Q08992	237 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	FCY1	Q12178	158 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37

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