RNA–Protein interactions for RNA: YOR317W

FAA1, Transcript of Long chain fatty acyl-CoA synthetase, yeast

Gene FAA1, Length 2,103 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FAA1	YOR317W	TRR2	P38816	342 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	EGT2	P42835	1041 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	YIP1	P53039	248 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	BUD32	P53323	261 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	SWS2	P53937	143 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	APS2	Q00381	147 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	MAK3	Q03503	176 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	COQ10	Q08058	207 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	MED7	Q08278	222 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	PEX11	Q12462	236 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	YKR104W	P0CE69	306 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	TFS1	P14306	219 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	GCN3	P14741	305 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	MDM10	P18409	493 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	CLB2	P24869	491 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	ATG22	P25568	528 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	MRPL3	P36516	390 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	MRPL15	P36523	253 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	SIM1	P40472	476 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	HAC1	P41546	238 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	MEP2	P41948	499 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	TMA23	Q03525	211 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	YML053C	Q04978	212 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	SEI1	Q06058	285 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	YDL218W	Q07629	317 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	YLR030W	Q07967	263 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	IRC10	Q08118	586 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	MDM32	Q12171	622 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	IGO2	Q9P305	131 aa		3.58	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	COX4	P04037	155 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	SDS24	P38314	527 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	PEX22	P39718	180 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	MOB2	P43563	287 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	PMT4	P46971	762 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	MCM22	P47167	239 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	COG7	P53195	279 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	RSM27	P53305	110 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	RAV2	Q03956	351 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	LOA1	Q06508	300 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	MCH1	Q07376	486 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	YLL056C	Q12177	298 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	GEP5	Q12393	293 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	MHT1	Q12525	324 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	SEC59	P20048	519 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	PCL1	P24867	279 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	YBR053C	P38235	358 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	CHL4	P38907	458 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	XBP1	P40489	647 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	KEG1	P43614	200 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	UBC13	P52490	153 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	HST4	P53688	370 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	CUZ1	P53899	274 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	DAD3	P69850	94 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	TDA1	Q03533	586 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	ATP14	Q12349	124 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	SWM1	Q12379	170 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	HAP2	P06774	265 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	YBR056W	P38081	501 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	DOG2	P38773	246 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	DOG1	P38774	246 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	RPP1	P38786	293 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	PEX7	P39108	375 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	ARG2	P40360	574 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	YPS5	P53057	165 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	MRM2	P53123	320 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	MRX11	Q03079	207 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	TRM12	Q04235	462 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	DIC1	Q06143	298 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	CNL1	Q06333	122 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	YLR012C	Q07927	99 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	YAP7	Q08182	245 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	YPL257W	Q08974	193 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	PFA4	Q12006	378 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	RFM1	Q12192	310 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	CPR3	P25719	182 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	LEU5	P38702	357 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	VHT1	P53241	593 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAA1	YOR317W	YPR098C	Q06089	161 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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