RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W FLC3P53121 802 aa4.79□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W FMP41P53889 259 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W SNO1Q03144 224 aa4.79□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W YLR281CQ05863 155 aa4.79□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W YPR091CQ06833 770 aa4.79□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W YFH1Q07540 174 aa4.79□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W ATG10Q07879 167 aa4.79□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W SCP1Q08873 200 aa4.79□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W FDH1Q08911 376 aa4.79□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W TFC7Q12415 435 aa4.79□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W AHC1Q12433 566 aa4.79□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W DET1Q99288 334 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W YFR010W-AP0C5N0 62 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W YKR104WP0CE69 306 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W TRS65P32893 560 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W YCR041WP37265 110 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W POG1P40473 351 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W OTU1P43558 301 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W YIP1P53039 248 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W YGL235WP53071 178 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W YGL204CP53089 101 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W OKP1P53298 406 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W SCW4P53334 386 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W BUD25P85052 153 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W STF1P01098 86 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W NAM2P11325 894 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W YBL010CP32788 280 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W SDS24P38314 527 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W TAE1P38340 232 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W SMB1P40018 196 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W GAT2P40209 560 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W EMC5P40540 141 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W GIM3P53900 129 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W MMT2Q08970 484 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W VPS68Q12016 184 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W YPR145C-AQ2V2P0 78 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W ODC2Q99297 307 aa4.78□□□□□ -1.64
VHS1YDR247W PBN1P25580 416 aa4.77□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W MSK1P32048 576 aa4.77□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data4.77□□□□□ -1.65not detected
VHS1YDR247W ARC40P38328 384 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W DED81P38707 554 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W RMD6P39975 231 aa4.77□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W SYS1P41544 203 aa4.77□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W AGX1P43567 385 aa4.77□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W CIN2P46670 268 aa4.77□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W GWT1P47026 490 aa4.77□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YNR062CP53748 327 aa4.77□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YCL001W-AP87012 153 aa4.77□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W ARL3Q02804 198 aa4.77□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W BER1Q06688 274 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W SDO1Q07953 250 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W TPI1P00942 248 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YPK2P18961 677 aa4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W VMA5P31412 392 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W TIM12P32830 109 aa4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W SUI1P32911 108 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YOR062CP36025 268 aa4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W VPS51P36116 164 aa4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W CHK1P38147 527 aa4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W TRM7P38238 310 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YPC1P38298 316 aa4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data4.76□□□□□ -1.65 RIP-Chip
VHS1YDR247W YAL037WP39728 267 aa4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YIR035CP40579 254 aa4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YPS6P40583 537 aa4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YJL016WP47072 561 aa4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W GPI14P47088 403 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W PNC1P53184 216 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W CTF19Q02732 369 aa4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W EST3Q03096 181 aa4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W INP1Q03694 420 aa4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W SNA4Q07549 140 aa4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W RRT7Q07829 113 aa4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YPR063CQ12160 140 aa4.76□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data4.75□□□□□ -1.65not detected
VHS1YDR247W MSN4P33749 630 aa4.75□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W COS9P36034 407 aa4.75□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W ERV15P38312 142 aa4.75□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W TRR2P38816 342 aa4.75□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W GPI16P38875 610 aa4.75□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W SEN34P39707 275 aa4.75□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YIL169CP40442 995 aa4.75□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W AVT7P40501 490 aa4.75□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W IKS1P47042 667 aa4.75□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W CCC1P47818 322 aa4.75□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W NIF3P53081 288 aa4.75□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YIP5P53108 310 aa4.75□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W RVB1Q03940 463 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YML096WQ04489 525 aa4.75□□□□□ -1.65
VHS1YDR247W YPR172WQ06608 200 aa4.75□□□□□ -1.65
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