RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 MIEF2Q96C03 454 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 LDAHQ9H6V9 325 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 ZBED9Q6R2W3 1325 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 PTPN7P35236 360 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 APBA1Q02410 837 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 SP140Q13342 867 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 GBX1Q14549 363 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 IL17RAQ96F46 866 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 TCF25Q9BQ70 676 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 NCOA1Q15788 1441 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 FGD6Q6ZV73 1430 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 CNTLNQ9NXG0 1405 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 ZMYM3Q14202 1370 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 GCC2Q8IWJ2 1684 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 A0A087X1B8 175 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 SLC16A6O15403 523 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 GPR32O75388 356 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 ALDH2P05091 517 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 IL2RBP14784 551 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 DDCP20711 480 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 PCSK1P29120 753 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 DEKP35659 375 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 GNALP38405 381 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 MAN2A2P49641 1150 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 FLT3LGP49771 235 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 INHBCP55103 352 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 TBX4P57082 545 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 MTM1Q13496 603 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 RAB39AQ14964 217 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 DGKHQ86XP1 1220 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 DENND1CQ8IV53 801 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 IFI44Q8TCB0 444 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 STON2Q8WXE9 905 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 RAB24Q969Q5 203 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 CEP95Q96GE4 821 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 TMEM140Q9NV12 185 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 NAIPQ13075 1403 aa6.3□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 PRC1O43663 620 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 RPS6KA4O75676 772 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 STC2O76061 302 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 FPR1P21462 350 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 MAP2K6P52564 334 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 INHBEP58166 350 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 GRM3Q14832 879 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 RSPH3Q86UC2 560 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 RGMAQ96B86 450 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 ARL8AQ96BM9 186 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 TMX3Q96JJ7 454 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 GPR87Q9BY21 358 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 KCNH6Q9H252 994 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 TEX33O43247 280 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 B3GALT2O43825 422 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 TUSC2O75896 110 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 UBXN7O94888 489 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 IL12RB1P42701 662 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 HK3P52790 923 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 CTXN1P60606 82 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 TLE1Q04724 770 aa6.28□□□□□ -1.4
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