Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HK3P52790 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
HK3P52790 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
HK3P52790 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HK3P52790 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
HK3P52790 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HK3P52790 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
HK3P52790 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HK3P52790 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HK3P52790 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HK3P52790 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HK3P52790 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HK3P52790 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HK3P52790 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
HK3P52790 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HK3P52790 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HK3P52790 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HK3P52790 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HK3P52790 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HK3P52790 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HK3P52790 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
HK3P52790 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HK3P52790 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HK3P52790 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
HK3P52790 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HK3P52790 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HK3P52790 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HK3P52790 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HK3P52790 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HK3P52790 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HK3P52790 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HK3P52790 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HK3P52790 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HK3P52790 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HK3P52790 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HK3P52790 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HK3P52790 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HK3P52790 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HK3P52790 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HK3P52790 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HK3P52790 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HK3P52790 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HK3P52790 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HK3P52790 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HK3P52790 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HK3P52790 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HK3P52790 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
HK3P52790 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
HK3P52790 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HK3P52790 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HK3P52790 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HK3P52790 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HK3P52790 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
HK3P52790 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HK3P52790 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HK3P52790 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HK3P52790 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
HK3P52790 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HK3P52790 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HK3P52790 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HK3P52790 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HK3P52790 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HK3P52790 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HK3P52790 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HK3P52790 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HK3P52790 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HK3P52790 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HK3P52790 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HK3P52790 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HK3P52790 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HK3P52790 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HK3P52790 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HK3P52790 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HK3P52790 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HK3P52790 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HK3P52790 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HK3P52790 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HK3P52790 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HK3P52790 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HK3P52790 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HK3P52790 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HK3P52790 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HK3P52790 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HK3P52790 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HK3P52790 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HK3P52790 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HK3P52790 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HK3P52790 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HK3P52790 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HK3P52790 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HK3P52790 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HK3P52790 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HK3P52790 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HK3P52790 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HK3P52790 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HK3P52790 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HK3P52790 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HK3P52790 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HK3P52790 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HK3P52790 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms