RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516746.1

RNU6-567P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 567, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-567P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-567P-201ENST00000516746 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 C7orf25Q9BPX7 421 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 TTPALQ9BTX7 342 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 SORCS3Q9UPU3 1222 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 DMRT1Q9Y5R6 373 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 CCDC78A2IDD5 438 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 PHF2O75151 1096 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 PPFIA2O75334 1257 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 PPFIA4O75335 1185 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 GPR32O75388 356 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 RECQL4O94761 1208 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 ENDOD1O94919 500 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 GASTP01350 101 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 GYPEP15421 78 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 DDCP20711 480 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 APBA1Q02410 837 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 DUSP2Q05923 314 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 NOGQ13253 232 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 MAP9Q49MG5 647 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 AFMIDQ63HM1 303 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 METRNLQ641Q3 311 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 MRGPREQ86SM8 312 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 XYLT1Q86Y38 959 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 SYT12Q8IV01 421 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 DNAJC10Q8IXB1 793 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 CPT1CQ8TCG5 803 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 ZG16BQ96DA0 208 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 TMX3Q96JJ7 454 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 CLPTM1LQ96KA5 538 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 AGAP2Q99490 1192 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 MAP3K14Q99558 947 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 B3GNT5Q9BYG0 378 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 TMEM60Q9H2L4 133 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 BHMT2Q9H2M3 363 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 ARNT2Q9HBZ2 717 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 NR2E3Q9Y5X4 410 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 F2RL2O00254 374 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 APAF1O14727 1248 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 KIF3BO15066 747 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 TRIM24O15164 1050 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 FOXN1O15353 648 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 PRSS23O95084 383 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 ABHD16AO95870 558 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 SLC5A1P13866 664 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 KRT4P19013 534 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 VCAM1P19320 739 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 MALP21145 153 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 HTR1BP28222 390 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 FLT3LGP49771 235 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 GZMKP49863 264 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 SP140Q13342 867 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 PLS1Q14651 629 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 LLGL1Q15334 1064 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 GFOD2Q3B7J2 385 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 MINDY4Q4G0A6 757 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 FAM47AQ5JRC9 791 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 CCDC181Q5TID7 509 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 LAIR1Q6GTX8 287 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 KCNV1Q6PIU1 500 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 NPNTQ6UXI9 565 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 Q6ZPA2 131 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 LRRC55Q6ZSA7 311 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 FAM83AQ86UY5 434 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 FAM90A1Q86YD7 464 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 PLXDC1Q8IUK5 500 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 DENND1CQ8IV53 801 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 OR52N2Q8NGI0 321 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 KLHDC4Q8TBB5 520 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 PROKR1Q8TCW9 393 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 LENG9Q96B70 501 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 RGMAQ96B86 450 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 IL17RAQ96F46 866 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 NEU1Q99519 415 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 NDC1Q9BTX1 674 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 LANCL2Q9NS86 450 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 TDP1Q9NUW8 608 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 FBXO34Q9NWN3 711 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-567P-201ENST00000516746 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms