RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 CPT1AP50416 773 aa30.61■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF568Q3ZCX4 644 aa30.61■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SEZ6Q53EL9 994 aa30.61■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 EEF1DP3Q658K8 133 aa30.61■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDT1Q9H211 546 aa30.61■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SNX12Q9UMY4 172 aa30.61■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 HAS3O00219 553 aa30.6■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 BUB1O43683 1085 aa30.6■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 BIRC3Q13489 604 aa30.6■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 ELF2Q15723 593 aa30.6■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR5B17Q8NGF7 314 aa30.6■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 PI4K2AQ9BTU6 479 aa30.6■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP30.6■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 V9GYY5 206 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 VTNP04004 478 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM253P0C7T8 217 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 MCF2P10911 925 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 GALCP54803 685 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 LMBR1Q8WVP7 490 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 CYP26A1O43174 497 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 B4GALT4O60513 344 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SGPL1O95470 568 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHMP4BP1P59074 171 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRIM32Q13049 653 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC20A1Q8WUM9 679 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM84AQ96KN4 292 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 ISCUQ9H1K1 167 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SETD4Q9NVD3 440 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 NCANO14594 1321 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 GZMAP12544 262 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHRNB2P17787 502 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 NFRKBQ6P4R8 1299 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SH3TC2Q8TF17 1288 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 GOLGA1Q92805 767 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 AP5M1Q9H0R1 490 aa30.58■■■□□ 2.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CYP11B1P15538 503 aa30.57■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 USP8P40818 1118 aa30.57■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 KYAT1Q16773 422 aa30.57■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 RABGGTAQ92696 567 aa30.57■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 TLR10Q9BXR5 811 aa30.57■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP30.57■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 HTTP42858 3142 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANKRD62A6NC57 917 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 PALMO75781 387 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 IL18RAPO95256 599 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 INHAP05111 366 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 TCP1P17987 556 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADAM17P78536 824 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 NCOA4Q13772 614 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 MFSD10Q14728 455 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 TCEAL1Q15170 157 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 DUOXA2Q1HG44 320 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 PDZD7Q9H5P4 517 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANK1P16157 1881 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 GRID2IPA4D2P6 1211 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC47A2Q86VL8 602 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 PALB2Q86YC2 1186 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 NLRP7Q8WX94 980 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADAMTS10Q9H324 1103 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CNTN6Q9UQ52 1028 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 HYOU1Q9Y4L1 999 aa30.56■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CTAGE15A4D2H0 777 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CTAGE8P0CG41 777 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 AKR1A1P14550 325 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 PSEN2P49810 448 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDR2Q01850 454 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM132AQ24JP5 1023 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CTAGE6Q86UF2 777 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CTAGE4Q8IX94 777 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 THNSL1Q8IYQ7 743 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRRC57Q8N9N7 239 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 ASS1P00966 412 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CLTAP09496 248 aa30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 BPIFB4P59827 614 aa30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CUL2Q13617 745 aa30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 MEI1Q5TIA1 1274 aa30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 RFFLQ8WZ73 363 aa30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 TSPAN1O60635 241 aa30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms