RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472218.1

RPS18-231, Transcript of ribosomal protein S18, human

TSL 2

Gene RPS18, Length 1,109 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS18-231	ENST00000472218	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	ATP8B3	O60423	1300 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218		F8VZ95	297 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	PITPNM1	O00562	1244 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF623	O75123	536 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	SGPL1	O95470	568 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	HLA-DRA	P01903	254 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC175	P0C221	793 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	ACTN1	P12814	892 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	SOX5	P35711	763 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	TNFSF9	P41273	254 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	BIRC3	Q13489	604 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	NCOA4	Q13772	614 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	ASIC2	Q16515	512 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	IQCE	Q6IPM2	695 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	VPS36	Q86VN1	386 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	TTC39C	Q8N584	583 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	CPB2	Q96IY4	423 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC42	Q96M95	316 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	DEFB118	Q96PH6	123 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	CNTN3	Q9P232	1028 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RPS18-231	ENST00000472218	LACTBL1	A8MY62	500 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	PHACTR2	O75167	634 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	NDUFA10	O95299	355 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	LCA5L	O95447	670 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	NPTXR	O95502	500 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	CXCL8	P10145	99 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	KCNE1	P15382	129 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	CYP3A5	P20815	502 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	PIK3CA	P42336	1068 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	BPIFB4	P59827	614 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	TRPC3	Q13507	836 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	UBXN11	Q5T124	520 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	SHC3	Q92529	594 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	SEMA4D	Q92854	862 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	SNX27	Q96L92	541 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	VNN1	O95497	513 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	CD4	P01730	458 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	COL6A1	P12109	1028 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	CKB	P12277	381 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	P4HA1	P13674	534 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	SELP	P16109	830 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	PAX3	P23760	479 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	GJA8	P48165	433 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	RBP5	P82980	135 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	PAK2	Q13177	524 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	MTFR1	Q15390	333 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	SPA17	Q15506	151 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS18-231	ENST00000472218	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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