RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 TNFSF13BQ9Y275 285 aa28.02■■■□□ 2.08
RP9-201ENST00000297157 USP20Q9Y2K6 914 aa28.02■■■□□ 2.08
RP9-201ENST00000297157 FAM186AA6NE01 2351 aa28.01■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 MYH11P35749 1972 aa28.01■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 A0A087X0B3 334 aa28.01■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 ABLIM1O14639 778 aa28.01■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 STK38Q15208 465 aa28.01■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 USP41Q3LFD5 358 aa28.01■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 LILRA6Q6PI73 481 aa28.01■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 GPBP1Q86WP2 473 aa28.01■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 B3GALT6Q96L58 329 aa28.01■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 FIZ1Q96SL8 496 aa28.01■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 CCDC169A6NNP5 214 aa28■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 PROZP22891 400 aa28■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 NCKAP1LP55160 1127 aa28■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa28■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 FLCNQ8NFG4 579 aa28■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa28■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 CCDC39Q9UFE4 941 aa28■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 SPTBN4Q9H254 2564 aa28■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 SLC16A4O15374 487 aa27.99■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 TGM5O43548 720 aa27.99■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 MAPTP10636 758 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 ATF7IP2Q5U623 682 aa27.99■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 MYADMQ96S97 322 aa27.99■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 KLK14Q9P0G3 267 aa27.99■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 NARSO43776 548 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 SCP2P22307 547 aa27.98■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 CREMQ03060 361 aa27.98■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa27.98■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 ASCL5Q7RTU5 278 aa27.98■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 PALB2Q86YC2 1186 aa27.98■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 PARP2Q9UGN5 583 aa27.98■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 RCOR1Q9UKL0 485 aa27.98■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 PRR23AA6NEV1 266 aa27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 PI15O43692 258 aa27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 CUTAO60888 179 aa27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 SPATA31D3P0C874 917 aa27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 MYBP10242 640 aa27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 TXLNAP40222 546 aa27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 TUSC3Q13454 348 aa27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 RRAGBQ5VZM2 374 aa27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 CCDC105Q8IYK2 499 aa27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 SIX5Q8N196 739 aa27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 KCNG4Q8TDN1 519 aa27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 NXPE3Q969Y0 559 aa27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 PAAF1Q9BRP4 392 aa27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 WNT16Q9UBV4 365 aa27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 FBXL21Q9UKT6 434 aa27.97■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP27.96■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 SMTNP53814 917 aa27.96■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 E2F4Q16254 413 aa27.96■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 RTP2Q5QGT7 225 aa27.96■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 SHC4Q6S5L8 630 aa27.96■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa27.96■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 RASSF8Q8NHQ8 419 aa27.96■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 RSAD2Q8WXG1 361 aa27.96■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 RABGGTAQ92696 567 aa27.96■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 DNAJC19Q96DA6 116 aa27.96■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 RTP3Q9BQQ7 232 aa27.96■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 ADPGKQ9BRR6 497 aa27.96■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 PRKD2Q9BZL6 878 aa27.96■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 PARVGQ9HBI0 331 aa27.96■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 CACNG4Q9UBN1 327 aa27.96■■■□□ 2.07
RP9-201ENST00000297157 PTGESO14684 152 aa27.95■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 RPL17P18621 184 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 ZPBP2Q6X784 338 aa27.95■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 CDT1Q9H211 546 aa27.95■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa27.95■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 CFAP45Q9UL16 551 aa27.95■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 MYMKA6NI61 221 aa27.94■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 H0YCG3 227 aa27.94■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 TADA2AO75478 443 aa27.94■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 LIG1P18858 919 aa27.94■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 NAB2Q15742 525 aa27.94■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 HAUS6Q7Z4H7 955 aa27.94■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 GLYCTKQ8IVS8 523 aa27.94■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 SLC44A3Q8N4M1 653 aa27.94■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 SNTG2Q9NY99 539 aa27.94■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP27.94■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 FBXW11Q9UKB1 542 aa27.94■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa27.94■■■□□ 2.06
RP9-201ENST00000297157 KRBA1A5PL33 1030 aa27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms