RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249501.4

HOXD10-201, Transcript of homeobox D10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD10, Length 1,989 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-201ENST00000249501 ARID3AQ99856 593 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 SYT11Q9BT88 431 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 ASGR1P07306 291 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 DARSP14868 501 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 CDC42EP1Q00587 391 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 SURF1Q15526 300 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 KCNA10Q16322 511 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 WDR44Q5JSH3 913 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 ACP6Q9NPH0 428 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 NAGPAQ9UK23 515 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 PJA2O43164 708 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 CCDC172P0C7W6 258 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 NCOA4Q13772 614 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 SLC20A1Q8WUM9 679 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 NENFQ9UMX5 172 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 BRCA2P51587 3418 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 FAM170AA1A519 330 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 LACTBL1A8MY62 500 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 CYP26A1O43174 497 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 URI1O94763 535 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 SGPL1O95470 568 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 CLTAP09496 248 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 SNX17Q15036 470 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 FMNL3Q8IVF7 1028 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD10-201ENST00000249501 B4GALT4O60513 344 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 CLSTN1O94985 981 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 AP3M2P53677 418 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 GCNT1Q02742 428 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 VPS36Q86VN1 386 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 MYRIPQ8NFW9 859 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.52■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 NPTXRO95502 500 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 NFICP08651 508 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 ANXA13P27216 316 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 NAB2Q15742 525 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 ERO1AQ96HE7 468 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 AGPAT1Q99943 283 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 FKTNO75072 461 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 IL18RAPO95256 599 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 MOCS3O95396 460 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 UQCRHP07919 91 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 TNFAIP3P21580 790 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 MYL6P60660 151 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 JADE1Q6IE81 842 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 SLC47A2Q86VL8 602 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 PALB2Q86YC2 1186 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 WNT8BQ93098 351 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 CALCAP01258 141 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 NME8Q8N427 588 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 EPS8L1Q8TE68 723 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 L2HGDHQ9H9P8 463 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 TSKSQ9UJT2 592 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 GRIN2DO15399 1336 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 TNNC2P02585 160 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 KRT5P13647 590 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXD10-201ENST00000249501 TERF1P54274 439 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.5 ms