RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 FcgrtQ61559 365 aa15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nudt16Q6P3D0 195 aa15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 LgsnQ8CIX8 563 aa15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pcdha9Q91Y11 979 aa15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 ArpinQ9D0A3 226 aa15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr456B2RT27 312 aa15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rad54lP70270 747 aa15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cct5P80316 541 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp91Q62511 572 aa15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Elmo3Q8BYZ7 720 aa15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr390Q8VEZ7 311 aa15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr458Q8VF80 313 aa15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr457Q8VGP5 313 aa15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Caskin2Q8VHK1 1201 aa15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cables1Q9ESJ1 568 aa15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ggps1Q9WTN0 300 aa15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 S1pr4Q9Z0L1 386 aa15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rasgrp1Q9Z1S3 795 aa15.96■□□□□ 0.15
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fbf1A2A870 1173 aa15.96■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Capn2O08529 700 aa15.96■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TxkP42682 527 aa15.96■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lpar1P61793 364 aa15.96■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Odr4Q4PJX1 447 aa15.96■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lilrb4Q64281 335 aa15.96■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Retreg2Q6NS82 541 aa15.96■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ntrk3Q6VNS1 825 aa15.96■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atp6v0d2Q80SY3 350 aa15.96■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adgra1Q8C4G9 578 aa15.96■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pdxdc1Q99K01 787 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 IdeQ9JHR7 1019 aa15.96■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sh3bp2Q06649 559 aa15.95■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cyfip2Q5SQX6 1253 aa15.95■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gngt1Q61012 74 aa15.95■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rufy1Q8BIJ7 712 aa15.95■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myef2Q8C854 591 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mill1Q8HWE7 395 aa15.95■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ces1fQ91WU0 561 aa15.95■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Castor1Q9CWQ8 331 aa15.95■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Spata31d1aE9QA35 1336 aa15.95■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 GclmO09172 274 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ankfy1Q810B6 1169 aa15.95■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Creb3l2Q8BH52 521 aa15.95■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Qsox1Q8BND5 748 aa15.95■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Isl2Q9CXV0 359 aa15.95■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tbx20Q9ES03 445 aa15.95■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hic1Q9R1Y5 733 aa15.95■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dennd4aE9Q8V6 1869 aa15.95■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm4846B2RWH8 538 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CaluO35887 315 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccnd3P30282 292 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hmgcs2P54869 508 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Acot5Q6Q2Z6 421 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc20a2Q80UP8 656 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Usp27Q8CEG8 438 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vopp1Q8R1C3 172 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rpp40Q8R1F9 363 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 McmbpQ8R3C0 642 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PpanQ91YU8 470 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mrpl2Q9D773 306 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 R3hdm1E9Q9Q2 1135 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hoxc6P10629 235 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tnni3P48787 211 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ephb4P54761 987 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam193bQ3U2K0 892 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bbof1Q3V079 533 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lsm14bQ8CGC4 385 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Upb1Q8VC97 393 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Aipl1Q924K1 328 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wdr83Q9DAJ4 315 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kiaa1522A2A7S8 1013 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Miga1Q4QQM5 600 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 OgtQ8CGY8 1046 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam83aQ8K2P2 436 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q9D2Q3 444 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 3830403N18RikQ9D6C3 208 aa15.94■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mrgprb1Q3UG61 350 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SpopQ6ZWS8 374 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kbtbd3Q8BHI4 607 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fbxo44Q8BK26 255 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fermt3Q8K1B8 665 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ssr1Q9CY50 286 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dydc1Q9D9T0 175 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr67F8VPJ8 320 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfpm1O35615 995 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prom1O54990 867 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Scarf2P59222 833 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 LbpQ61805 481 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dzip3Q7TPV2 1204 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mageb18Q8BQR7 327 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 N4bp3Q8C7U1 537 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam114a1Q9D281 569 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MefvQ9JJ26 767 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 EloblA6PWE0 161 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppfia4B8QI36 1187 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PrkcbP68404 671 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc10a4Q3UEZ8 437 aa15.93■□□□□ 0.14
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adad1Q5SUE7 619 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.6 ms