Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
Rad54lP70270 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rad54lP70270 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rad54lP70270 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Rad54lP70270 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rad54lP70270 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rad54lP70270 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Rad54lP70270 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Rad54lP70270 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rad54lP70270 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Rad54lP70270 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Rad54lP70270 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Rad54lP70270 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Rad54lP70270 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rad54lP70270 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rad54lP70270 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rad54lP70270 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Rad54lP70270 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rad54lP70270 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rad54lP70270 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rad54lP70270 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rad54lP70270 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rad54lP70270 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rad54lP70270 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rad54lP70270 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rad54lP70270 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rad54lP70270 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Rad54lP70270 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rad54lP70270 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rad54lP70270 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rad54lP70270 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rad54lP70270 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rad54lP70270 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Rad54lP70270 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rad54lP70270 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rad54lP70270 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Rad54lP70270 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Rad54lP70270 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rad54lP70270 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rad54lP70270 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rad54lP70270 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rad54lP70270 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rad54lP70270 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rad54lP70270 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rad54lP70270 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rad54lP70270 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Rad54lP70270 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rad54lP70270 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rad54lP70270 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rad54lP70270 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rad54lP70270 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rad54lP70270 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rad54lP70270 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rad54lP70270 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rad54lP70270 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rad54lP70270 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Rad54lP70270 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rad54lP70270 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rad54lP70270 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rad54lP70270 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rad54lP70270 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rad54lP70270 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rad54lP70270 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rad54lP70270 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Rad54lP70270 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Rad54lP70270 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rad54lP70270 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rad54lP70270 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rad54lP70270 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rad54lP70270 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rad54lP70270 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Rad54lP70270 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rad54lP70270 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rad54lP70270 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rad54lP70270 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rad54lP70270 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rad54lP70270 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rad54lP70270 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rad54lP70270 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rad54lP70270 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rad54lP70270 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rad54lP70270 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rad54lP70270 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rad54lP70270 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rad54lP70270 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rad54lP70270 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rad54lP70270 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rad54lP70270 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rad54lP70270 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rad54lP70270 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rad54lP70270 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rad54lP70270 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rad54lP70270 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rad54lP70270 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rad54lP70270 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rad54lP70270 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rad54lP70270 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Rad54lP70270 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rad54lP70270 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rad54lP70270 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms