Protein–RNA interactions for Protein: Q4PJX1

Odr4, Protein odr-4 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odr4Q4PJX1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Odr4Q4PJX1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Odr4Q4PJX1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Odr4Q4PJX1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Odr4Q4PJX1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Odr4Q4PJX1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Odr4Q4PJX1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Odr4Q4PJX1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Odr4Q4PJX1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Odr4Q4PJX1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Odr4Q4PJX1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Odr4Q4PJX1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Odr4Q4PJX1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Odr4Q4PJX1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Odr4Q4PJX1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Odr4Q4PJX1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Odr4Q4PJX1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Odr4Q4PJX1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Odr4Q4PJX1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Odr4Q4PJX1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Odr4Q4PJX1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Odr4Q4PJX1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Odr4Q4PJX1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Odr4Q4PJX1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Odr4Q4PJX1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Odr4Q4PJX1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Odr4Q4PJX1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Odr4Q4PJX1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Odr4Q4PJX1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Odr4Q4PJX1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Odr4Q4PJX1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Odr4Q4PJX1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Odr4Q4PJX1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Odr4Q4PJX1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Odr4Q4PJX1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Odr4Q4PJX1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Odr4Q4PJX1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Odr4Q4PJX1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Odr4Q4PJX1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Odr4Q4PJX1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Odr4Q4PJX1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Odr4Q4PJX1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Odr4Q4PJX1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Odr4Q4PJX1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Odr4Q4PJX1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Odr4Q4PJX1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Odr4Q4PJX1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Odr4Q4PJX1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Odr4Q4PJX1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Odr4Q4PJX1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Odr4Q4PJX1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Odr4Q4PJX1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Odr4Q4PJX1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Odr4Q4PJX1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Odr4Q4PJX1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Odr4Q4PJX1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Odr4Q4PJX1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Odr4Q4PJX1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Odr4Q4PJX1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Odr4Q4PJX1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Odr4Q4PJX1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Odr4Q4PJX1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Odr4Q4PJX1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Odr4Q4PJX1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Odr4Q4PJX1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Odr4Q4PJX1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Odr4Q4PJX1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Odr4Q4PJX1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Odr4Q4PJX1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Odr4Q4PJX1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Odr4Q4PJX1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Odr4Q4PJX1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Odr4Q4PJX1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Odr4Q4PJX1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Odr4Q4PJX1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Odr4Q4PJX1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Odr4Q4PJX1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Odr4Q4PJX1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Odr4Q4PJX1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Odr4Q4PJX1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Odr4Q4PJX1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Odr4Q4PJX1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Odr4Q4PJX1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Odr4Q4PJX1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Odr4Q4PJX1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Odr4Q4PJX1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Odr4Q4PJX1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Odr4Q4PJX1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Odr4Q4PJX1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Odr4Q4PJX1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Odr4Q4PJX1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Odr4Q4PJX1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Odr4Q4PJX1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Odr4Q4PJX1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Odr4Q4PJX1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Odr4Q4PJX1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Odr4Q4PJX1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Odr4Q4PJX1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Odr4Q4PJX1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Odr4Q4PJX1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms