RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	PPQ1	P32945	549 aa		9.49	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	APL3	P38065	1025 aa		9.49	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	QDR1	P40475	563 aa		9.49	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	9.49	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	PHB2	P50085	310 aa		9.49	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	AVT4	P50944	713 aa		9.49	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	YDR391C	Q04170	232 aa		9.49	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	YOR385W	Q08909	290 aa		9.49	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	RDI1	Q12434	202 aa		9.49	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	9.48	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	OTU1	P43558	301 aa		9.48	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	YLR283W	Q05867	314 aa		9.48	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	9.47	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	URA3	P03962	267 aa		9.47	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	HEM4	P06174	275 aa		9.47	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	DIT1	P21623	536 aa		9.47	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	FLO10	P36170	1169 aa		9.47	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	9.47	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	9.47	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	SPR28	Q04921	423 aa		9.47	□□□□□ -0.89
DDR2	YOL052C-A	ATG15	P25641	520 aa		9.46	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	MRPS5	P33759	307 aa		9.46	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	YER084W	P40057	128 aa		9.46	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	MOB2	P43563	287 aa		9.46	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	RSM27	P53305	110 aa		9.46	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	RFU1	Q08003	200 aa		9.46	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	COX17	Q12287	69 aa		9.46	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	SPS4	P09937	338 aa		9.45	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	IFM1	P25038	676 aa		9.45	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	BOL3	P39724	118 aa		9.45	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	SKP1	P52286	194 aa		9.45	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	TEL1	P38110	2787 aa		9.45	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	TOR1	P35169	2470 aa		9.44	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	MTC7	P32633	139 aa		9.44	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	REC114	P32841	428 aa		9.44	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	ALG12	P53730	551 aa		9.44	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	HNM1	P19807	563 aa		9.43	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	CPR4	P25334	318 aa		9.43	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	MRPL36	P36531	177 aa		9.43	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	GPI16	P38875	610 aa		9.43	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	SEN34	P39707	275 aa		9.43	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	YND1	P40009	630 aa		9.43	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	ATF1	P40353	525 aa		9.43	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	SIP18	P50263	79 aa		9.43	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	YIP5	P53108	310 aa		9.43	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	ARG5,6	Q01217	863 aa		9.43	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	FIT3	Q08907	204 aa		9.43	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	TRM13	Q12383	476 aa		9.43	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	AAC1	P04710	309 aa		9.42	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	MET3	P08536	511 aa		9.42	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	STF2	P16965	84 aa		9.42	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	YBL010C	P32788	280 aa		9.42	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	VAM7	P32912	316 aa		9.42	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	YKL063C	P35725	167 aa		9.42	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	RRF1	P38771	230 aa		9.42	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	TYW3	P53177	273 aa		9.42	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	VBA1	Q04301	562 aa		9.42	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	CRR1	Q05790	422 aa		9.42	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	ARG80	P07249	177 aa		9.41	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	MCH2	P36032	473 aa		9.41	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	ACS1	Q01574	713 aa		9.41	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	ERP4	Q12450	207 aa		9.41	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	PET20	Q99373	253 aa		9.41	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	SAG1	P20840	650 aa		9.4	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	MAK32	P23060	363 aa		9.4	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	YCR101C	P25607	182 aa		9.4	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	MRP17	P28778	131 aa		9.4	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	FMT1	P32785	401 aa		9.4	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	CLB6	P32943	380 aa		9.4	□□□□□ -0.9
DDR2	YOL052C-A	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9

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