RNA–Protein interactions for RNA: YMR309C

NIP1, Transcript of eIF3c subunit of the eukaryotic translation initiation factor 3 (eIF3), yeast

Gene NIP1, Length 2,439 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NIP1	YMR309C	POF1	P25576	258 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	BLI1	P35727	113 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YIL001W	P40560	513 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	MRX5	P47007	382 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	GOT1	Q03554	138 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	SWI1	P09547	1314 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	MSW1	P04803	379 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	OAC1	P32332	324 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YKE4	P40544	346 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	NAS2	P40555	220 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YNL260C	P53846	198 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	RSM10	Q03201	203 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YDR124W	Q04608	324 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	BCP1	Q06338	283 aa		0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	POX1	P13711	748 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	FZO1	P38297	855 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	OSW5	P40219	148 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	FIS1	P40515	155 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YJR012C	P47087	207 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YGL185C	P53100	379 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	SPP2	Q02521	185 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	VBA1	Q04301	562 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	MGR3	Q04472	501 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	SML1	Q04964	104 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	NEJ1	Q06148	342 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YLR162W	Q06235	118 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	LOA1	Q06508	300 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	MET5	P47169	1442 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	VAR1	P02381	398 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	DDI2	P0CH63	225 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	DDI3	P0CH64	225 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	MSA2	P36157	363 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	MRPL39	P36533	70 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	HSM3	P38348	480 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	TCD1	P38756	429 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	DOG1	P38774	246 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YAR068W	P39564	161 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YER189W	P40104	122 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YJR079W	P47126	109 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	SWS2	P53937	143 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YDR286C	Q05530	114 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	CUR1	Q06469	252 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YPL257W	Q08974	193 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YPL162C	Q12042	273 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	MDY2	Q12285	212 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	EMP46	Q12396	444 aa		0.11	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YLR462W	O13556	202 aa		0.1	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	0.1	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	PEX18	P38855	283 aa		0.1	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YEL075C	P39972	122 aa		0.1	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	HUA1	P40325	198 aa		0.1	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	MNT4	P53745	580 aa		0.1	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YMR007W	Q03675	126 aa		0.1	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	ATG39	Q06159	398 aa		0.1	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	ATG17	Q06410	417 aa		0.1	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.09	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	SGE1	P33335	543 aa		0.09	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	NBP35	P52920	328 aa		0.09	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	SPO19	Q03029	223 aa		0.09	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	YDR209C	Q03480	137 aa		0.09	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	FAR8	Q05040	523 aa		0.09	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	ARV1	Q06541	321 aa		0.09	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	PGC1	Q08959	321 aa		0.09	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	0.09	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	0.09	□□□□□ -2.39
NIP1	YMR309C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
NIP1	YMR309C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
NIP1	YMR309C	FCY2	P17064	533 aa		0.09	□□□□□ -2.4
NIP1	YMR309C	VPS3	P23643	1011 aa		0.09	□□□□□ -2.4
NIP1	YMR309C	UPS2	P35200	230 aa		0.09	□□□□□ -2.4
NIP1	YMR309C	YKL070W	P36087	169 aa		0.09	□□□□□ -2.4
NIP1	YMR309C	YHR180W	P38868	163 aa		0.09	□□□□□ -2.4
NIP1	YMR309C	VPS45	P38932	577 aa		0.09	□□□□□ -2.4
NIP1	YMR309C	PGD1	P40356	397 aa		0.09	□□□□□ -2.4
NIP1	YMR309C	RMR1	P53060	241 aa		0.09	□□□□□ -2.4
NIP1	YMR309C	YGL159W	P53110	370 aa		0.09	□□□□□ -2.4
NIP1	YMR309C	TOS8	P53147	276 aa		0.09	□□□□□ -2.4
NIP1	YMR309C	GTR2	P53290	341 aa		0.09	□□□□□ -2.4
NIP1	YMR309C	HEM25	Q07534	307 aa		0.09	□□□□□ -2.4
NIP1	YMR309C	YLR030W	Q07967	263 aa		0.09	□□□□□ -2.4
NIP1	YMR309C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	0.09	□□□□□ -2.4

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