RNA–Protein interactions for RNA: YLR250W

SSP120, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene SSP120, Length 705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSP120	YLR250W	MTH1	P35198	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	THI2	P38141	450 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	DLS1	P40366	167 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	FMP33	P46998	180 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	CCC1	P47818	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	AVT4	P50944	713 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	PMT5	P52867	743 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	COG5	P53951	403 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	YLR152C	P54072	576 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	FIN1	Q03898	291 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	ASR1	Q06834	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	GSH2	Q08220	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	FRE3	Q08905	711 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	EAF3	Q12432	401 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	HXT2	P23585	541 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	PPZ2	P33329	710 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	SDS22	P36047	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	SNL1	P40548	159 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	YGL114W	P53134	725 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	SPR28	Q04921	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	MRX10	Q05648	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	HUT1	Q12520	339 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	ENA1	P13587	1091 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	CNE1	P27825	502 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	MTC7	P32633	139 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	OSH7	P38755	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	FMC1	P40491	155 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	YJR120W	P47157	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	ERP6	P53198	216 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	VPS71	Q03433	280 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	HLR1	Q04429	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	ARP10	Q04549	284 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	FRE5	Q08908	694 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	FCY1	Q12178	158 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	RFM1	Q12192	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	ATP10	P18496	279 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	VMA3	P25515	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	VPS17	P32913	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	PRY2	P36110	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	NAT2	P37293	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	SDS24	P38314	527 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	MDM31	P38880	579 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	XPT1	P47165	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	YGL262W	P53054	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	MRH4	P53166	561 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	YPL067C	Q02754	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	FIG1	P38224	298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	NTA1	P40354	457 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	FIP1	P45976	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	SSN8	P47821	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	YGR045C	P53229	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	YNL234W	P53857	426 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	GRC3	Q07845	632 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSP120	YLR250W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	FUN26	P31381	517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	CCZ1	P38273	704 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	AIM46	P38885	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	BUD8	P41698	603 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	POP6	P53218	158 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	SLI1	P53304	468 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	ARR2	Q06597	130 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	ATO3	Q12359	275 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	PRE4	P30657	266 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	YBR285W	P38354	144 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSP120	YLR250W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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