RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP4	YHR069C	YDR391C	Q04170	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	FRE3	Q08905	711 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	FIT3	Q08907	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	RCN2	Q12044	265 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	ORT1	Q12375	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
RRP4	YHR069C	YLR358C	O13565	187 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	SGA1	P08019	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	YKL069W	P36088	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	MBA1	P38300	278 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	MSS4	P38994	779 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	ATF1	P40353	525 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	DLS1	P40366	167 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	AVT7	P40501	490 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	ATG18	P43601	500 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	SIP18	P50263	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	YIP5	P53108	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	ERV29	P53337	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	BUD25	P85052	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	RSM23	Q01163	450 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	TDA1	Q03533	586 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	CNE1	P27825	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	SPT14	P32363	452 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	RCN1	P36054	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	APL3	P38065	1025 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	MIT1	P40002	666 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	SER2	P42941	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	YFL054C	P43549	646 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	POP6	P53218	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	FMP48	P53233	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	TPO3	Q06451	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	TGS1	Q12052	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
RRP4	YHR069C	DSF1	P0CX08	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	NAM2	P11325	894 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	SPS100	P13130	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	PET18	P25362	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	PRE4	P30657	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	MTC7	P32633	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	SNC2	P33328	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	PPZ2	P33329	710 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	YIL060W	P40519	144 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	YJL055W	P47044	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	IRC18	P47056	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	HNT2	P49775	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	YGL159W	P53110	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	SLI1	P53304	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	RNH201	P53942	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	ACS1	Q01574	713 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	PEX30	Q06169	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
RRP4	YHR069C	INP53	Q12271	1107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	RNH203	Q12338	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	REC114	P32841	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	CLB6	P32943	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	PTC7	P38797	343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	FLX1	P40464	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	YNR048W	P53740	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	NRK1	P53915	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	KEI1	Q06346	221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	GAT3	Q07928	141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRP4	YHR069C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	HXT2	P23585	541 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	AFG1	P32317	509 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	DBF20	P32328	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	UMP1	P38293	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YBR220C	P38318	560 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	PIG2	P40187	538 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	YJL016W	P47072	561 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	VHT1	P53241	593 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRP4	YHR069C	DLT1	Q04216	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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