RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	MSS18	P08593	268 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	VPS17	P32913	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
SYF2	YGR129W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
SYF2	YGR129W	TRM5	P38793	499 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	TIR3	P40552	269 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	SFH5	P47008	294 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	HMS2	P47175	358 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	ISA2	Q12425	185 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	ATP10	P18496	279 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	HXT2	P23585	541 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	YCL002C	P25565	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	AUA1	P32450	94 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	SKG1	P36169	355 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	FRM2	P37261	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	YBR184W	P38299	523 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	CHL4	P38907	458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	HIS6	P40545	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	RET2	P43621	546 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	SLD3	P53135	668 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	YPL067C	Q02754	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	SPC19	Q03954	165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	MRX8	Q05473	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	RIB3	Q99258	208 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	PHO85	P17157	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	QRI7	P43122	407 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	DSL1	P53847	754 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	SAM50	P53969	484 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	FZO1	P38297	855 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	IPT1	P38954	527 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	SPO73	P40031	143 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	TRS85	P46944	698 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	PMT5	P52867	743 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	ASI2	P53895	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	PGA1	P53896	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	ELP6	Q04868	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	MLC2	Q06580	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	FRE3	Q08905	711 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	FCY1	Q12178	158 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
SYF2	YGR129W	CLB4	P24871	460 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	DOA4	P32571	926 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	YBR144C	P34215	104 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	PHB2	P50085	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	MIG2	P53035	382 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	PRM8	P53174	237 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	YNL095C	P53932	642 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	OST6	Q03723	332 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	AIM6	Q07716	390 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF2	YGR129W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	MDM10	P18409	493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	PHO80	P20052	293 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	INO2	P26798	304 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	YPK3	P38070	525 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	SBE22	P38814	852 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	YFL015C	P43578	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	YJL163C	P46996	555 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	MRH4	P53166	561 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	NRK1	P53915	240 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	ECM18	Q04623	453 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	LIP2	Q06005	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	TGS1	Q12052	315 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	PTP2	P29461	750 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	NAT2	P37293	288 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	ECM31	P38122	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	SIC1	P38634	284 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	AAH1	P53909	347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	GAL83	Q04739	417 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	SCW10	Q04951	389 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	BCP1	Q06338	283 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	ASA1	Q06822	443 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	GRC3	Q07845	632 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	ENV7	Q12003	364 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	RFM1	Q12192	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF2	YGR129W	TPK3	P05986	398 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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