RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	YGL082W	P53155	381 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	SUN4	P53616	420 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	NRM1	P53718	249 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	ATP23	P53722	227 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	TIM44	Q01852	431 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YOL073C	Q08232	322 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	AKR2	Q12013	749 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YLR112W	Q12130	139 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	SCO1	P23833	295 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	CPR4	P25334	318 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	ARO7	P32178	256 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	MRPL39	P36533	70 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	ECM14	P38836	430 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	GLE2	P40066	365 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	PCI8	P40512	444 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	RTS2	P40962	232 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	MOB2	P43563	287 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	AIM25	P47140	327 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	SWP1	Q02795	286 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YMR010W	Q03687	405 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YML018C	Q03730	393 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YDL199C	Q12407	687 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	RAX2	Q12465	1220 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	PRM4	Q12498	284 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	FCY2	P17064	533 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	PHA2	P32452	334 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	EFM1	P38732	585 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	NVJ1	P38881	321 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	COX14	P39103	70 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	HEM14	P40012	539 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YGR018C	P53211	109 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	SUR7	P54003	302 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YDR476C	Q03362	224 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	BSP1	Q06604	576 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	IRC10	Q08118	586 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	MDM32	Q12171	622 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	HRT3	Q12347	344 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YLR111W	Q12528	110 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	RIB3	Q99258	208 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	MHP1	P43638	1398 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	MDM10	P18409	493 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	MRPS28	P21771	286 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	CDC50	P25656	391 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	OCH1	P31755	480 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	AEP1	P32493	518 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YBR137W	P38276	179 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	PAN6	P40459	309 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	RRT5	P43607	289 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	LCB3	P47013	409 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	FLC3	P53121	802 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	HSK3	P69852	69 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	PET191	Q02772	108 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	RSC9	Q03124	581 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YMR181C	Q03231	154 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YMD8	Q03697	442 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	LOA1	Q06508	300 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	EAF3	Q12432	401 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	HEM4	P06174	275 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	KIN28	P06242	306 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	ATG15	P25641	520 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	SFK1	P35735	353 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	PRY2	P36110	329 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YBR285W	P38354	144 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	RCK1	P38622	512 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YHL049C	P38722	271 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	HPM1	P40481	377 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YFL064C	P43540	174 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YJR015W	P47090	510 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	TPC1	P53257	314 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YNL184C	P53876	108 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	CRZ1	P53968	678 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	UBC7	Q02159	165 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	PIR3	Q03180	325 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YDR249C	Q03787	373 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	RAV2	Q03956	351 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	CSN9	Q03981	162 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	NEJ1	Q06148	342 aa		3.43	□□□□□ -1.86

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 146 ms