RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	OSBP2	Q969R2	916 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	ACD	Q96AP0	544 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	LURAP1	Q96LR2	239 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	FNBP1	Q96RU3	617 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM209	Q96SK2	561 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR182	O15218	404 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	IGSF3	O75054	1194 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF883	P0CG24	379 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CEBPB	P17676	345 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	GNAI1	P63096	354 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	SGO2	Q562F6	1265 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	USP53	Q70EK8	1073 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	RLN3	Q8WXF3	142 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	RUBCNL	Q9H714	662 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	IFT57	Q9NWB7	429 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	GINS2	Q9Y248	185 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	ACAN	P16112	2415 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	AP5Z1	O43299	807 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	MTSS1	O43312	755 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	VPS4B	O75351	444 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CER1	O95813	267 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CDK4	P11802	303 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CD99	P14209	185 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	ITGB5	P18084	799 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	GNLY	P22749	145 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	HOXA9	P31269	272 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	P2RY2	P41231	377 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC11A1	P49279	550 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT76	Q01546	638 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	GRIK4	Q16099	956 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	SLFN13	Q68D06	897 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	LILRA6	Q6PI73	481 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	RASSF3	Q86WH2	238 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	ASB16	Q96NS5	453 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	GBP3	Q9H0R5	595 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	VPS4A	Q9UN37	437 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PQD8	194 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CHAD	O15335	359 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	PRKCG	P05129	697 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	TTC30A	Q86WT1	665 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	LSMEM2	Q8N112	164 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	SMARCD2	Q92925	531 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	NOTCH4	Q99466	2003 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	CILP	O75339	1184 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	RFPL3	O75679	317 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-223	ENST00000627440	RHO	P08100	348 aa		7.3	□□□□□ -1.24

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