RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-208ENST00000481518 SMTNP53814 917 aa25.24■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 NCKAP1LP55160 1127 aa25.24■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 USP41Q3LFD5 358 aa25.24■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 XKR4Q5GH76 650 aa25.24■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 RTP2Q5QGT7 225 aa25.24■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 TMC5Q6UXY8 1006 aa25.24■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 RASSF8Q8NHQ8 419 aa25.24■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 CLIC6Q96NY7 704 aa25.24■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 TCHPQ9BT92 498 aa25.24■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa25.24■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 ADH1AP07327 375 aa25.23■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 HARSP12081 509 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 STRN3Q13033 797 aa25.23■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 ALKAL1Q6UXT8 129 aa25.23■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 SNX27Q96L92 541 aa25.23■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 NECTIN4Q96NY8 510 aa25.23■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 SFXN1Q9H9B4 322 aa25.23■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa25.23■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 TRIP11Q15643 1979 aa25.23■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa25.22■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 TOM1L1O75674 476 aa25.22■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 MYBP10242 640 aa25.22■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 RPL17P18621 184 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 MTHFRP42898 656 aa25.22■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 ZNF131P52739 623 aa25.22■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 SEZ6Q53EL9 994 aa25.22■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 HAUS6Q7Z4H7 955 aa25.22■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 RIPOR3Q96MK2 946 aa25.22■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 HAPLN2Q9GZV7 340 aa25.22■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 MAN1C1Q9NR34 630 aa25.22■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 KCNG1Q9UIX4 513 aa25.22■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 FAM13AO94988 1023 aa25.21■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 CLCNKBP51801 687 aa25.21■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 YARSP54577 528 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 FAM171A1Q5VUB5 890 aa25.21■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 CD300LGQ6UXG3 332 aa25.21■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 ZPBP2Q6X784 338 aa25.21■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 GPR149Q86SP6 731 aa25.21■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 GLYCTKQ8IVS8 523 aa25.21■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 GPR65Q8IYL9 337 aa25.21■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 KCNN1Q92952 543 aa25.21■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.21■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 DENND4AQ7Z401 1863 aa25.21■■□□□ 1.63
PSME4-208ENST00000481518 PRR33A8MZF0 331 aa25.2■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 GLUD1P00367 558 aa25.2■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 SPATA31D3P0C874 917 aa25.2■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 ATAT1Q5SQI0 421 aa25.2■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa25.2■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 PALB2Q86YC2 1186 aa25.2■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 MYCT1Q8N699 235 aa25.2■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 C3orf58Q8NDZ4 430 aa25.2■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 ACAP3Q96P50 834 aa25.2■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 FIZ1Q96SL8 496 aa25.2■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 PARVGQ9HBI0 331 aa25.2■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.621e-7■■■■□ 25.9
PSME4-208ENST00000481518 FNIP2Q9P278 1114 aa25.2■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 C2orf16Q68DN1 1984 aa25.19■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.19■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 C2CD4DB7Z1M9 353 aa25.19■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa25.19■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 B3GAT3O94766 335 aa25.19■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 DDIT3P35638 169 aa25.19■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 MCL1Q07820 350 aa25.19■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 SLC39A14Q15043 492 aa25.19■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 UPP1Q16831 310 aa25.19■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 CEP57Q86XR8 500 aa25.19■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 TTPALQ9BTX7 342 aa25.19■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 CNTN3Q9P232 1028 aa25.19■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 VWA8A3KMH1 1905 aa25.19■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 MYH15Q9Y2K3 1946 aa25.18■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 H0YCG3 227 aa25.18■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 K7ENM7 598 aa25.18■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 TGM5O43548 720 aa25.18■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 RFPL2O75678 378 aa25.18■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 KCNE1P15382 129 aa25.18■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 SLC10A6Q3KNW5 377 aa25.18■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 LILRA6Q6PI73 481 aa25.18■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 PIK3R5Q8WYR1 880 aa25.18■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 EDAQ92838 391 aa25.18■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.18■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 TBX20Q9UMR3 447 aa25.18■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 NR2E1Q9Y466 385 aa25.18■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 CLDN3O15551 220 aa25.17■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 TRAK2O60296 914 aa25.17■■□□□ 1.62
PSME4-208ENST00000481518 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
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