RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476612.1

UBE2Q1-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, human

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 301 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RAB34	Q9BZG1	259 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		4.37	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612		A0A0B4J269	797 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612		I3L4J1	428 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PPEF2	O14830	753 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SPTLC2	O15270	562 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TGM5	O43548	720 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TRAK2	O60296	914 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PPP6R2	O75170	966 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TOM1L1	O75674	476 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RFPL2	O75678	378 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	BMP15	O95972	392 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	F13A1	P00488	732 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PIGR	P01833	764 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MCF2	P10911	925 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	KCNE1	P15382	129 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	KLRC2	P26717	231 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	BRCC3	P46736	316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CLCNKB	P51801	687 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CASP5	P51878	434 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GTF2B	Q00403	316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GRIK3	Q13003	919 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TUSC3	Q13454	348 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZPBP2	Q6X784	338 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RNF135	Q8IUD6	432 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PDILT	Q8N807	584 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DDX12P	Q92771	950 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SNX27	Q96L92	541 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FBXL18	Q96ME1	805 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	POMK	Q9H5K3	350 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	KCND2	Q9NZV8	630 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.36	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SPTLC1	O15269	473 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CLDN3	O15551	220 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GPR37L1	O60883	481 aa		4.35	□□□□□ -1.71
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TADA2A	O75478	443 aa		4.35	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms