RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHR022CP38763 256 aa0.44□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q RCY1P39531 840 aa0.44□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q IBA57P47158 497 aa0.44□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNR062CP53748 327 aa0.44□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q PDR16P53860 351 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q CYT2Q00873 224 aa0.44□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q VPS20Q04272 221 aa0.44□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q SIA1Q12212 622 aa0.44□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL5P26321 297 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q PEX3P28795 441 aa0.43□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q UIP5P36137 443 aa0.43□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q SWC5P38326 303 aa0.43□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q FET3P38993 636 aa0.43□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGR026WP53217 278 aa0.43□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q SLX9P53251 210 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q CTF19Q02732 369 aa0.43□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR162WQ06235 118 aa0.43□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q LOA1Q06508 300 aa0.43□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q SLD7Q08457 257 aa0.43□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q CWP1P28319 239 aa0.42□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q SWI3P32591 825 aa0.42□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q TCD1P38756 429 aa0.42□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data0.42□□□□□ -2.34not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q YIA6P40556 373 aa0.42□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q SEC10Q06245 871 aa0.42□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q ASR1Q06834 288 aa0.42□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q USB1Q12208 290 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATO3Q12359 275 aa0.42□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q PAA1Q12447 191 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data0.41□□□□□ -2.34not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q COS8P38723 381 aa0.41□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q TDA11P38854 504 aa0.41□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q YKE4P40544 346 aa0.41□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC40P40968 455 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q LOH1P47055 219 aa0.41□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL37AP49166 88 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q ARP5P53946 755 aa0.41□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR279CQ03263 540 aa0.41□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATC1Q04005 294 aa0.41□□□□□ -2.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q Q0255P03881 472 aa0.4□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRM9P39551 298 aa0.4□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q SMD3P43321 101 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGR219WP53307 113 aa0.4□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q GPN3Q06543 272 aa0.4□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q AKR2Q12013 749 aa0.4□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC37P06101 506 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL4AP10664 362 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q GPA2P10823 449 aa0.39□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q RCN1P36054 211 aa0.39□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERV15P38312 142 aa0.39□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q SVP26P38869 228 aa0.39□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL4BP49626 362 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q KEL2P50090 882 aa0.39□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL37BP51402 88 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q RCF1Q03713 159 aa0.39□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q EMI1Q04406 187 aa0.39□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q EMP46Q12396 444 aa0.39□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOS9Q99220 542 aa0.39□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa0.39□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q PET18P25362 215 aa0.38□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q OAC1P32332 324 aa0.38□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q HUA1P40325 198 aa0.38□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q PML1Q07930 204 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q PSY3Q12318 242 aa0.38□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q ILV1P00927 576 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q CAR2P07991 424 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q AGP3P43548 558 aa0.37□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERV29P53337 310 aa0.37□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR007WQ03675 126 aa0.37□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q AIM36Q03798 255 aa0.37□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q CTR3Q06686 241 aa0.37□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q NFI1Q12216 726 aa0.37□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q ICL1P28240 557 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRS4P38063 326 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q APE4P38821 490 aa0.36□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q END3P39013 349 aa0.36□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q AIM20P40451 204 aa0.36□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q SML1Q04964 104 aa0.36□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q BER1Q06688 274 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q POM33Q12164 279 aa0.36□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q FKS1P38631 1876 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHR032W-AP0C5N6 59 aa0.35□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q SAR1P20606 190 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q EBP2P36049 427 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHR125WP38831 101 aa0.35□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q SER33P40510 469 aa0.35□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q YIL001WP40560 513 aa0.35□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR297WQ05899 129 aa0.35□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERP4Q12450 207 aa0.35□□□□□ -2.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHL049CP38722 271 aa0.34□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q SSO2P39926 295 aa0.34□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q ICE2P40499 491 aa0.34□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q AGE2P40529 298 aa0.34□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q RIB4P50861 169 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q PEX31P53203 462 aa0.34□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q TIM21P53220 239 aa0.34□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q VOA1P53262 265 aa0.34□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q MPA43P53583 542 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q COX5AP00424 153 aa0.33□□□□□ -2.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL9AP05738 191 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.5 ms