RNA–Protein interactions for RNA: YMR275C

BUL1, Transcript of Ubiquitin-binding component of the Rsp5p E3-ubiquitin ligase complex, yeast

Gene BUL1, Length 2,931 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUL1	YMR275C	MTM1	P53320	366 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	SAM50	P53969	484 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BUL1	YMR275C	RIP1	P08067	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	UTR1	P21373	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	PET18	P25362	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	SER3	P40054	469 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	SLZ1	P40167	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	VBA1	Q04301	562 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	SCEI	P03882	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	CDC23	P16522	626 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	LDB16	P25587	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	MRPL3	P36516	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	SYS1	P41544	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	OTU1	P43558	301 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	LOH1	P47055	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	NRK1	P53915	240 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	RSM28	Q03430	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	COQ11	Q05892	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	GAS2	Q06135	555 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	FLO9	P39712	1322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	COX5B	P00425	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	RNH201	P53942	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	MCT1	Q12283	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	RRI1	Q12468	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	MTL1	P53214	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	CDC34	P14682	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	URA6	P15700	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	DIT1	P21623	536 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	PPG1	P32838	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	UMP1	P38293	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	BUD8	P41698	603 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	HOL1	P53389	586 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	RSC58	Q07979	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	OKP1	P53298	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	RSM27	P53305	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	YEL057C	P39983	233 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	CTK2	P46962	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	PHB2	P50085	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	YNR040W	P53736	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	THI72	Q08579	599 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	FSH3	Q99369	266 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	DSF1	P0CX08	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	NAM2	P11325	894 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	PUG1	P40100	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	GPG1	P53130	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	GRE1	Q08969	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	SRL2	Q12020	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	RPB10	P22139	70 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	AFG1	P32317	509 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	AVT7	P40501	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	SLI1	P53304	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	GIM3	P53900	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	RSM10	Q03201	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	YDL180W	Q12301	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	MRP17	P28778	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	ORM1	P53224	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	RSM23	Q01163	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	FEX2	Q08991	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	PHO2	P07269	559 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	CHO1	P08456	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	MOH1	P38191	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	FIG1	P38224	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	RRF1	P38771	230 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	MTC6	P38849	526 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	YGL159W	P53110	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	TYW3	P53177	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUL1	YMR275C	TNA1	P53322	534 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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