RNA–Protein interactions for RNA: YMR118C

SHH3, Transcript of Putative mitochondrial inner membrane protein of unknown function, yeast

Gene SHH3, Length 591 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHH3	YMR118C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	MRPL37	P36532	105 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	SDH4	P37298	181 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	AVT5	P38176	459 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	SDS24	P38314	527 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	MGE1	P38523	228 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	MET30	P39014	640 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	HEM14	P40012	539 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	YNL195C	P40168	261 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	MNT3	P40549	630 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	HXT14	P42833	540 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	OTU1	P43558	301 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	AGX1	P43567	385 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	DAN1	P47178	298 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	YGL204C	P53089	101 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	PKP2	P53170	491 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	ERV14	P53173	138 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	TIM21	P53220	239 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	AAH1	P53909	347 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	APJ1	P53940	528 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	OCA2	P53949	197 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	TGL2	P54857	326 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	CTF19	Q02732	369 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	ROY1	Q04847	553 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	SNO4	Q04902	237 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	HOF1	Q05080	669 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	ARR2	Q06597	130 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	AIM6	Q07716	390 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	FDH1	Q08911	376 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	MMT2	Q08970	484 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	HSP32	Q08992	237 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	RAD28	Q12021	506 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	PUS9	Q12069	462 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	YDL211C	Q12121	372 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	ODC2	Q99297	307 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	MSB2	P32334	1306 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	URA6	P15700	204 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	MGR1	P25573	417 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	SCM4	P32564	187 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	CLB6	P32943	380 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	MDL1	P33310	695 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	MSN4	P33749	630 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	MRPL4	P36517	319 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	CHK1	P38147	527 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	TRR2	P38816	342 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	GPI16	P38875	610 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	PIC2	P40035	300 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	TOK1	P40310	691 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	RFC2	P40348	353 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	YIL060W	P40519	144 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	NIT2	P47016	307 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	YJR056C	P47115	236 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	AIM24	P47127	394 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	UBP8	P50102	471 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	NIF3	P53081	288 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	TNA1	P53322	534 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	YNR062C	P53748	327 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
SHH3	YMR118C	REC102	Q02721	264 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	EST3	Q03096	181 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	TMN2	Q04562	672 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	RRT7	Q07829	113 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	THI73	Q07904	523 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	YOR114W	Q12219	294 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	PET20	Q99373	253 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	MRPL44	P19956	98 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	CPR4	P25334	318 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	ERG4	P25340	473 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	ADH7	P25377	361 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	POF1	P25576	258 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SHH3	YMR118C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 49.5 ms