RNA–Protein interactions for RNA: YLR333C

RPS25B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS25B, Length 327 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS25B	YLR333C	DCN1	Q12395	269 aa		0.46	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	ECM13	P38195	257 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	HIS2	P38635	335 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	PRM9	P39551	298 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	SER33	P40510	469 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	OST2	P46964	130 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	PEX31	P53203	462 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	CPD1	P53314	239 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	ASI3	P53983	676 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	RSM10	Q03201	203 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	EMI1	Q04406	187 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	VAC14	Q06708	880 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	MDH2	P22133	377 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	GPI12	P23797	304 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	CSM1	P25651	190 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	CWP1	P28319	239 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	PEX4	P29340	183 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	RPC25	P35718	212 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	0.44	□□□□□ -2.34	not detected
RPS25B	YLR333C	GLE2	P40066	365 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	BMT5	P40493	336 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	MRPS8	Q03799	155 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	RRG8	Q06109	277 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	SFH1	Q06168	426 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	ATO3	Q12359	275 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	YOS9	Q99220	542 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	SPT7	P35177	1332 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	DSF1	P0CX08	502 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	YNR073C	P0CX09	502 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	YGL010W	P25338	174 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	SWI3	P32591	825 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	RCN1	P36054	211 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	YBR219C	P38317	127 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	YBR220C	P38318	560 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	PRM10	P42946	383 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	NUP57	P48837	541 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	TIM21	P53220	239 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	YNL050C	P53952	270 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	ABZ2	Q03266	374 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	YHL049C	P38722	271 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	DOG1	P38774	246 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	RCY1	P39531	840 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	0.42	□□□□□ -2.34	not detected
RPS25B	YLR333C	ERG25	P53045	309 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	SWS2	P53937	143 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	CYT2	Q00873	224 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	MGR3	Q04472	501 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	PEX10	Q05568	337 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	CUR1	Q06469	252 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.42	□□□□□ -2.34	not detected
RPS25B	YLR333C	CSI2	Q08054	341 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	PER33	Q12144	273 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	Q0255	P03881	472 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.41	□□□□□ -2.34	not detected
RPS25B	YLR333C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.41	□□□□□ -2.34	not detected
RPS25B	YLR333C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	YHR022C	P38763	256 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	VPS45	P38932	577 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	NBP35	P52920	328 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	YGR026W	P53217	278 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	ARP5	P53946	755 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	CTF19	Q02732	369 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	VBA1	Q04301	562 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	YDR286C	Q05530	114 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	BCP1	Q06338	283 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	AKR2	Q12013	749 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	YPR011C	Q12251	326 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	BBP1	Q12365	385 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	EMP46	Q12396	444 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RPS25B	YLR333C	SEC22	P22214	214 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RPS25B	YLR333C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
RPS25B	YLR333C	POF1	P25576	258 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RPS25B	YLR333C	ERV15	P38312	142 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RPS25B	YLR333C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
RPS25B	YLR333C	COS8	P38723	381 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RPS25B	YLR333C	SHC1	P39000	512 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RPS25B	YLR333C	AVT2	P39981	480 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RPS25B	YLR333C	YNR062C	P53748	327 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RPS25B	YLR333C	PGC1	Q08959	321 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RPS25B	YLR333C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
RPS25B	YLR333C	DDI2	P0CH63	225 aa		0.39	□□□□□ -2.35
RPS25B	YLR333C	DDI3	P0CH64	225 aa		0.39	□□□□□ -2.35

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.6 ms