RNA–Protein interactions for RNA: YKR080W

MTD1, Transcript of NAD-dependent 5,10-methylenetetrahydrafolate dehydrogenase, yeast

Gene MTD1, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTD1	YKR080W	JIP3	O13555	125 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	CSE1	P33307	960 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	PET8	P38921	284 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	FMP48	P53233	369 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YDR222W	Q04925	415 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	MRX8	Q05473	314 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	MIM1	Q08176	113 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	PEX11	Q12462	236 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	RAD7	P06779	565 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	INO2	P26798	304 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	RRF1	P38771	230 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	RRG9	P40156	214 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	SNZ3	P43545	298 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	COX16	P47081	118 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	SNZ2	P53824	298 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	YMR244W	Q04018	355 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	APC4	Q04601	652 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	ATG10	Q07879	167 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	APC9	Q12107	265 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	IZH4	Q99393	312 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTD1	YKR080W	DAL80	P26343	269 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	ZRT3	P34240	503 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	PCL7	P40186	285 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	DSN1	P40568	576 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	GLG2	P47011	380 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	TIM13	P53299	105 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	SIA1	Q12212	622 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	CWP1	P28319	239 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	MCH2	P36032	473 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	FRT2	P39734	528 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	MIC19	P43594	170 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	SWC4	P53201	476 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	PEX31	P53203	462 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	BIO4	P53630	237 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	YNR066C	P53752	436 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	SPO19	Q03029	223 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	DYN1	P36022	4092 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	COX5A	P00424	153 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	RPL43B	P0CX26	92 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	UGA1	P17649	471 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	COX10	P21592	462 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	YPC1	P38298	316 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	YMR262W	P38430	313 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	PRM9	P39551	298 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	BDH1	P39714	382 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	YEL028W	P39989	153 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	YIL054W	P40524	105 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	ECM18	Q04623	453 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	SWC7	Q06707	132 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	VIK1	Q12045	647 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	LAG2	Q92325	660 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	STT4	P37297	1900 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.05	□□□□□ -1.92	not detected
MTD1	YKR080W	RAD10	P06838	210 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	PPH21	P23594	369 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	GPI12	P23797	304 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	FRM2	P37261	193 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	TRR2	P38816	342 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	SLM1	P40485	686 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	HOP2	P53187	214 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	ECM19	Q06011	112 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	YPR114W	Q06107	315 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	YLR446W	Q06204	433 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	YDL211C	Q12121	372 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	TRM10	Q12400	293 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	TFC7	Q12415	435 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	KEL2	P50090	882 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	UBC13	P52490	153 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	YGL118C	P53132	145 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	HST4	P53688	370 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	GMC1	Q04399	608 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	GRX8	Q05926	109 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MTD1	YKR080W	YOR292C	Q08743	309 aa		3.04	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 85.5 ms