RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	EHD3	P28817	500 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	PPG1	P32838	368 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	DLS1	P40366	167 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	SYS1	P41544	203 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	CUP9	P41817	306 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YGR210C	P42942	411 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	NIT2	P47016	307 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	RSM27	P53305	110 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	ASI3	P53983	676 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	ARG5,6	Q01217	863 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	VBA1	Q04301	562 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YLR224W	Q05947	369 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	RSC58	Q07979	502 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	MIM1	Q08176	113 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	ODC2	Q99297	307 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YAL064W-B	O13512	126 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	SEN2	P16658	377 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	PPA2	P28239	310 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	DBF20	P32328	564 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	LST4	P34239	828 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	SWM2	P40342	146 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	FMP48	P53233	369 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YGR066C	P53242	292 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	NRM1	P53718	249 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	PET191	Q02772	108 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	PIN2	Q12057	282 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	TMS1	Q12116	473 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	ORT1	Q12375	292 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	ATG31	Q12421	196 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	FMP16	Q12497	93 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	COX1	P00401	534 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	ARG80	P07249	177 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	DSF1	P0CX08	502 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YNR073C	P0CX09	502 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	UTR1	P21373	530 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	HXT2	P23585	541 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	ADH7	P25377	361 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	MRP17	P28778	131 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	ACB1	P31787	87 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	SNC2	P33328	115 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	LEU5	P38702	357 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	SHO1	P40073	367 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YIL060W	P40519	144 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YIP4	P53093	235 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	TYW3	P53177	273 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	JAC1	P53193	184 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	POP6	P53218	158 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YGR126W	P53274	230 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	DID2	P69771	204 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	BUD25	P85052	153 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	GAS2	Q06135	555 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YLR352W	Q06479	807 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	FEX1	Q08913	375 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YPL272C	Q08984	517 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	TRM13	Q12383	476 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	PRM4	Q12498	284 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	CTA1	P15202	515 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	FRM2	P37261	193 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.8	□□□□□ -1.48	not detected
MIA40	YKL195W	YER010C	P40011	234 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	SER3	P40054	469 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	AVT7	P40501	490 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	LOH1	P47055	219 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	PMT3	P47190	753 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	SLI1	P53304	468 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	TNA1	P53322	534 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	SAM50	P53969	484 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YPL039W	Q03080	316 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	PRM15	Q03262	622 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	CTS2	Q06350	511 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	SWM1	Q12379	170 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	HMS1	Q12398	434 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	URA3	P03962	267 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	SGA1	P08019	549 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	URA6	P15700	204 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	SPO7	P18410	259 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MIA40	YKL195W	SCO1	P23833	295 aa		5.79	□□□□□ -1.48

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