RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM160B2	Q86V87	743 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	PALB2	Q86YC2	1186 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	MIB2	Q96AX9	1013 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	SPACA7	Q96KW9	195 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	TGM5	O43548	720 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	CD97	P48960	835 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	SNAP25	P60880	206 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	TIMM10	P62072	90 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM189B	P81408	668 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	PTPRN	Q16849	979 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	UVSSA	Q2YD98	709 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	ODR4	Q5SWX8	454 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	VIT	Q6UXI7	678 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	USP49	Q70CQ1	688 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF169	Q8NCN4	708 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	XAGE2	Q96GT9	111 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	SDK2	Q58EX2	2172 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	ABCB11	O95342	1321 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440		B4E1Z4	1266 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	CCL16	O15467	120 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	SEMA7A	O75326	666 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS6KA5	O75582	802 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	CIAO1	O76071	339 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	GGPS1	O95749	300 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	C1R	P00736	705 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	UQCRFS1	P47985	274 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	DMC1	Q14565	340 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	STXBP2	Q15833	593 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	ARNTL	O00327	626 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF40	O75150	1001 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	ALDH1L1	O75891	902 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	ICAM1	P05362	532 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	GALT	P07902	379 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	CYP2D6	P10635	497 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	PPFIA1	Q13136	1202 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	GSE1	Q14687	1217 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	GORAB	Q5T7V8	394 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	HES3	Q5TGS1	186 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	LIN9	Q5TKA1	542 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	SYT13	Q7L8C5	426 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	YAF2	Q8IY57	180 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPYL6	Q8N831	410 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	NYAP2	Q9P242	653 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	KAT6A	Q92794	2004 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	VWA8	A3KMH1	1905 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	ESYT2	A0FGR8	921 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	SOD2	P04179	222 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF853	P0CG23	659 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	CDK8	P49336	464 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	GLUD2	P49448	558 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	FOSB	P53539	338 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	GRIK2	Q13002	908 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	ANO7	Q6IWH7	933 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM50	Q86XT4	487 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-223	ENST00000627440	TTC8	Q8TAM2	541 aa		7.34	□□□□□ -1.23

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