RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.39■□□□□ 0.85
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GCSHP2-201ENST00000560971 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.38■□□□□ 0.85
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GCSHP2-201ENST00000560971 PER2O15055 1255 aa20.38■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 LINC01565O15544 149 aa20.38■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 TOM1L1O75674 476 aa20.38■□□□□ 0.85
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GCSHP2-201ENST00000560971 COL19A1Q14993 1142 aa20.38■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 SEZ6Q53EL9 994 aa20.38■□□□□ 0.85
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GCSHP2-201ENST00000560971 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.38■□□□□ 0.85
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GCSHP2-201ENST00000560971 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.38■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.38■□□□□ 0.85
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GCSHP2-201ENST00000560971 IDEP14735 1019 aa20.37■□□□□ 0.85
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GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.37■□□□□ 0.85
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GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 TNMDQ9H2S6 317 aa20.37■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 CUEDC2Q9H467 287 aa20.37■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 TLE6Q9H808 572 aa20.37■□□□□ 0.85
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GCSHP2-201ENST00000560971 CLDN3O15551 220 aa20.36■□□□□ 0.85
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GCSHP2-201ENST00000560971 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
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GCSHP2-201ENST00000560971 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
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GCSHP2-201ENST00000560971 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.36■□□□□ 0.85
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GCSHP2-201ENST00000560971 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.36■□□□□ 0.85
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GCSHP2-201ENST00000560971 TAS1R1Q7RTX1 841 aa20.35■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.35■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 ACAP3Q96P50 834 aa20.35■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.35■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.35■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.35■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.35■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A1B0GVL5 298 aa20.34■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.34■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 TISP43B9A030 160 aa20.34■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.34■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 CMA1P23946 247 aa20.34■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 CASP1P29466 404 aa20.34■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 CASP5P51878 434 aa20.34■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 NUCB2P80303 420 aa20.34■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNA1Q09470 495 aa20.34■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 TUSC3Q13454 348 aa20.34■□□□□ 0.85
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